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首页> 外文期刊>Molecular Plant-Microbe Interactions >Chromosome-Scale Genome Assembly of Fusarium oxysporum Strain Fo47, a Fungal Endophyte and Biocontrol Agent
【24h】

Chromosome-Scale Genome Assembly of Fusarium oxysporum Strain Fo47, a Fungal Endophyte and Biocontrol Agent

机译：镰刀菌氧化菌菌株Fo47，真菌内食体和生物防治剂的染色体级基因组组装

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Here, we report a chromosome-level genome assembly of Fusarium oxysporum Fo47 (12 pseudomolecules; contig N50: 4.52 Mb), generated using a combination of PacBio long-read, Illumina paired end, and high-throughput chromosome conformation capture sequencing data. Although F. oxysporum causes vascular wilt to over 100 plant species, the strain Fo47 is classified as an endophyte and is widely used as a biocontrol agent for plant disease control. The Fo47 genome carries a single accessory chromosome of 4.23 Mb, compared with the reference genome of F. oxysporum f. sp. lycopersici Fol4287. The high-quality assembly and annotation of the Fo47 genome will be a valuable resource for studying the mechanisms underlying the endophytic interactions between F. oxysporum and plants as well as for deciphering the genome evolution of the F. oxysporum species complex.
机译：在这里，我们报告了镰刀菌孢子菌孢子菌菌的染色体级基因组组件（12假致颗粒; CONTIG N50：4.52 MB），使用PACBIO长读，Illumina成对端和高通量染色体构象捕获测序数据产生。虽然F. Oxysporum导致血管枯萎到100多种植物物种，但菌株Fo47被分类为内心细胞，并且广泛用作植物疾病控制的生物控制剂。与F. oxysporum f的参考基因组相比，Fo47基因组载有4.23mb的单个辅助染色体。 sp。 Lycopersici fol4287。 FO47基因组的高质量组装和注释将是研究F. oxysporum和植物之间的内生成相互作用的机制的宝贵资源，以及解密F. oxysporum物种复合物的基因组演化。

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