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Cytogenetic evidence of nucleolar dominance in allotetraploid species of Brachypodium

机译:腕足类异源四倍体物种核仁优势的细胞遗传学证据

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摘要

La coloration a` l’argent et l’hybridation in situ en fluorescence (« FISH ») ont e´te´ employe´es conse´cutivementnpour de´terminer l’activite´ et le nombre de sites d’ADNr 45S chez les apex racinaires me´riste´matiques de six e´cotypes d’espe`nces allote´traploı¨des (2n = 4x = 30) du genre Brachypodium et leurs anceˆtres putatifs B. distachyon (2n = 2x = 10) etnABR114 (2n = 2x = 20). En utilisant soit l’ADN nucle´aire total de l’ABR114, soit le clone BAC ABR1-63-E6 provenantnd’une banque ge´nomique du B. distachyon comme sonde auxiliaire, il a e´te´ possible de distinguer les deux ge´nomes composantnles e´cotypes des espe`ces te´traploı¨des du Brachypodium et de de´terminer clairement l’origine des ge`nes d’ARNr dominantsnou inactifs. Chacune des espe`ces diploı¨des posse´dait deux locus d’ADNr, tous deux actifs sur le planntranscriptionnel. Le nombre de sites d’ADNr 45S chez les six e´cotypes de Brachypodium allote´traploı¨de e´tait toujours e´galna` la somme des locus pre´sents chez leurs anceˆtres diploı¨des putatifs. Deux sites de plus petite taille e´taient localise´s sur lenchromosome provenant du jeu chromosomique de l’ABR114, tandis que les deux sites de plus grande taille provenaient dunB. distachyon. Chez tous les e´cotypes allote´traploı¨des examine´s, seuls les ge`nes d’ARNr appartenant au ge´nome de´rive´ dunB. distachyon e´taient transcrits, tandis que l’ADNr de l’autre ge´nome parental e´tait toujours inactif. Ainsi, la dominancennucle´olaire chez les espe`ces allote´traploı¨des (2n = 2x = 30) du genre Brachypodium est de´crite pour la premie`re fois.%Sequential silver staining and fluorescence in situ hybridization (FISH) were used to establish activity and numbernof 45S rDNA sites in meristematic root tip cells of 6 ecotypes of allotetraploid (2n = 4x = 30) species of Brachypodiumnand their putative ancestors, B. distachyon (2n = 2x = 10) and ABR114 (2n = 2x = 20). Using either total nuclearnDNA of ABR114 or the ABR1-63-E6 BAC clone from a B. distachyon genomic library as an auxiliary probe, it was possiblento distinguish by FISH between the two genomes composing the ecotypes of allotetraploid Brachypodium species andnto determine unambiguously the parentage of both dominant and suppressed rRNA genes. Each of the diploid species possessedntwo rDNA loci, both transcriptionally active. The number of 45S rDNA sites in 6 ecotypes of allotetraploid Brachypodiumnspecies was always equal to the sum of loci present in their putative diploid parents. Two smaller sites werenlocated in chromosomes corresponding to the ABR114 chromosomal set, and two larger ones in the chromosomes ofnB. distachyon origin. In all analyzed allotetraploid ecotypes, only rRNA genes belonging to the B. distachyon–like genomenwere transcriptionally active, while rDNA from the other parental genome was always suppressed. Thus the occurrence ofnnucleolar dominance in the allotetraploid (2n = 4x = 30) species of Brachypodium is demonstrated for the first time.
机译:连续使用银染和原位荧光杂交(“ FISH”)来确定顶点中45S rDNA位点的活性和数量。 Brachypodium属及其推定祖先B. distachyon(2n = 2x = 10)和nABR114(2n = 2x)的六个同种四倍体物种生态型(2n = 4x = 30)的分生根系统= 20)。通过使用来自B. distachyon基因库的ABR114的总核DNA或BAC克隆ABR1-63-E6作为辅助探针,可以区分这两个基因Nomes组成了Brachypodium四倍体物种的生态型,并清楚地确定了显性或非活性rRNA基因的起源。每个二倍体物种都有两个rDNA基因座,它们都在转录时间表上有活性。六个同种四倍体近距离生殖生态型中45S rDNA位点的数量仍等于其假定的二倍体祖先中存在的基因座总数。两个较小的位点位于ABR114染色体组的长染色体上,而两个较大的位点则来自dunB。 distachyon。在所有检查的异源四倍体生态型中,只有rRNA基因属于dunB衍生的基因组。 distachyon被转录,而另一个亲本基因组的rDNA仍然没有活性。因此,首次描述了短臂梭菌属的异倍体物种(2n = 2x = 30)中的核优势。%顺序银染和荧光原位杂交(FISH)用于建立6种异源四倍体(2n = 4x = 30)物种的分枝四倍体及其假定祖先B. distachyon(2n = 2x = 10)和ABR114(2n = 2x =)的分生组织根尖细胞的活性和数量20)。使用来自B. distachyon基因组文库的ABR114的总核DNA或ABR1-63-E6 BAC克隆的辅助探针,可以通过FISH区分组成异源四倍体近缘短种物种生态型的两个基因组,并明确确定其亲本。显性和抑制性rRNA基因。每个二倍体物种都具有两个rDNA基因座,两者都具有转录活性。 6个生态型异源四倍体Brachypodiumn物种中45S rDNA位点的数量始终等于其推定二倍体亲本中存在的基因座总数。两个较小的位点位于与ABR114染色体组相对应的染色体中,两个较大的位点位于nB染色体中。 distachyon的起源。在所有已分析的异源四倍体生态型中,只有属于远距离芽孢杆菌的rRNA基因(如基因组)具有转录活性,而来自其他亲本基因组的rDNA始终被抑制。因此,首次证明了在腕足菜的同种四倍体(2n = 4x = 30)物种中核仁优势。

著录项

  • 来源
    《Genome》 |2008年第5期|p.387-391|共5页
  • 作者

    Dominika; Hasterok Robert;

  • 作者单位

    D. Idziak and R. Hasterok.1 Department of Plant Anatomy andCytology, Faculty of Biology and Environmental Protection,University of Silesia, Jagiellonska 28, 40-032 Katowice, Poland.1Corresponding author (e-mail: hasterok@us.edu.pl).;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

    Brachypodium, FISH, nucleolar dominance, Poaceae, rDNA.;

    机译:腕足动物;FISH;核仁优势;禾本科;rDNA。;

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