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The 5S DNA sequences in Hordeum bogdanii and in the H. brevisubulatum complex, and the evolution and the geographic dispersal of the diploid Hordeum species (Triticeae: Poaceae)

机译:大麦和大麦草中的5S DNA序列,以及二倍体大麦物种的进化和地理分布(三叶科:禾本科)

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摘要

The molecular diversity of 5S rDNA from the closely related Asiatic diploid species, Hordeum bogdanii and the H. brevisubulatum complex has been catalogued and analysed. As in previous studies in Hordeum, we found that the sequences are constrained in such an manner that unit classes can be defined. The long H1 unit class, known to occur in all Eurasian species, was frequently found in these 2 taxa. In addition, we identified a new unit class, called the short H3 to reflect the H genome found in these 2 taxa. Although the 2 taxa are very close morphologically, the variation in the long H1 DNA units is constrained to such a great degree that, in many cases, the accessions in a unit class from a single species are clustered. In H.bogdanii, the majority of the sequences are grouped in this manner, whereas in the H. brevisubulatum complex, the tendency to be constrained is lower in some but not all subspecies. These results support keeping H. brevisubulatum ssp. violaceum and ssp. iranicum as 1 species with the long H1 and short H1 unit classes, while retaining ssp. nevskianum and ssp. turkestanicum in the H. brevisubulatum complex. We have summarized our work on the presence/absence of the 10 unit classes found in all diploid species of Hordeum. A phylogenetic analysis, based strictly on the presence/absence of unit classes, indicated clearly that all the South American diploids and all the North American diploids possess long H2 and long Y2 unit classes and, except for H. californicum and H. pusillum, which contain long H1 in addition to the long H2 and long Y2 classes, are devoid of the long H1 unit class. This suggests that the gene gain/loss process from a common ancestor has been concomitant with intercontinental dispersal between the Old and the New Worlds.La diversité moléculaire des ADNr 5S chez deux espèces asiatiques apparentées, Hordeum bogdanii et le complexe H. brevisubulatum, a été cataloguée et analysée. Comme lors de leurs études antérieures chez le genre Hordeum, les auteurs ont trouvé que ces séquences sont sous contrainte de telle façon que des classes unitaires sont définissables. La classe à longue unité H1, précédemment observée chez toutes les espèces eurasiatiques, est rencontrée fréquemment chez ces deux taxons. De plus, les auteurs ont identifié une nouvelle classe d'unité, appelée H3 courte, pour décrire le génome H présent chez ces deux taxons. Bien que les deux taxons soient très proches morphologiquement, la variation au sein des longues unités H1 est grandement contrainte de telle façon que, dans plusieurs cas, les accessions qui partagent la même unité au sein d'une espèce appartiennent à un même groupe. Chez le H. bogdanii, la majorité des séquences sont groupées de cette manière tandis que chez le complexe H. brevisubulatum, la contrainte est moins grande chez certaines mais pas toutes les sous-espèces. Ces résultats supportent le maintien des sous-espèces H. brevisubulatum ssp. violaceum et ssp. iranicum au sein de la même espèce caractérisée par des unités H1 longues et courtes tout en gardant les ssp. nevskianum et ssp. turkestanicum au sein du complexe H. brevisubulatum. Les auteurs ont résumé leur travail sur la présence/absence des 10 classes d'unités trouvées chez l'ensemble des espèces du genre Hordeum. Une analyse phylogénétique fondée strictement sur leur présence/absence indique clairement que toutes les espèces diploïdes d'Amérique du Sud et d'Amérique du Nord possèdent les longues unités H2 et Y2 et sont dépourvues des longues unités H1 si on fait exception des espèces H. californicum et H. pusillum, lesquelles possèdent les longues unités H1 en plus des longues H2 et Y2. Ceci suggère que les processus de gain ou de perte à partir d'un ancêtre commun seraient survenus en même temps que la dispersion intercontinentale entre les nouveaux et anciens mondes.
机译:已对来自密切相关的亚洲二倍体物种,大麦芽孢杆菌和短螺旋体的5S rDNA的分子多样性进行了分类和分析。像以前在Hordeum中的研究一样,我们发现序列受约束,可以定义单位类别。在这两个类群中经常发现长H1单位类别,已知发生在所有欧亚物种中。此外,我们确定了一个新的单元类别,称为短H3,以反映这两个类群中的H基因组。尽管两个分类单元在形态上非常接近,但是长H1 DNA单元的变异受到很大程度的限制,以致在许多情况下,单个物种的单位类别的种质聚集成簇。在H.bogdanii中,大多数序列都以这种方式分组,而在H. brevisubulatum复合物中,受约束的趋势在某些而非所有亚种中均较低。这些结果支持保持短双歧杆菌ssp。紫胶和ssp。 iranicum为1种,具有长H1和短H1单位类别,同时保留ssp。 nevskianum和ssp。短螺旋体复合体中的turkestanicum。我们总结了在大麦的所有二倍体物种中发现/不存在的10个单元类别的工作。严格根据单位类存在/不存在的系统发育分析清楚地表明,所有南美二倍体和所有北美二倍体均具有长H2和长Y2单位类,除了加州棉和棉铃虫,除了长H2和长Y2类之外,还包含长H1,因此没有长H1单元类。这表明来自共同祖先的基因增/减过程伴随着旧世界和新世界之间的洲际传播。亚洲品种研究杂志5S的亚洲表象,大麦和大杂种。 Catalogueéeetanalysée。普通高等法院的等级制考试报名,大剧院,大剧院和大剧院的等级制统一。 H1等级的贵族,法国观察到的旅行社,欧洲EST的旅行社,法国和法国的分类广告。此外,H3法院上诉法院,H3法院上诉法院,DécrireLeGénomeH法院,Décrire法院,Déunité法院,法新社和法新社。法国Bien que les deux分类群研究了形态学,高级变奏协和单位,Désplusieurs cas的诉说禁制令,部分加入了法国人的单身小组。 Chez le H. bogdanii,法语国家大学生小组,chéle lecélele complexe H. brevisubulatum,大禁忌,moes pas toutes lessous-espèces。 Cesrésultats支持主要维护人种H. brevisubulatum ssp。紫菜等H1 Longues et Courtes To la en gardant les ssp的iranicum au sein de lamêmeespècecaractériséepar desunités nevskianum等。土耳其土生植物复合体H. brevisubulatum。法国大剧院类别的10个单元的集体学习/缺席学习活动。联合国教科文组织分析了南/北阿塞拜疆人和北阿塞拜疆人长期以来在法国的留学/缺勤情况,并在此基础上对H2和Y2进行了长期的研究。 californicum et H. pusillum,lesquellespossèdentles longues unit H1 en plus des longues H2 et Y2。世界各地的洲际临时集会,以及在世界范围内散布的持久性有机污染物。

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