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STS markers for the wheat yellow rust resistance gene Yr5 suggest a NBS-LRR-type resistance gene cluster

机译：小麦黄锈病抗性基因Yr5的STS标记提示NBS-LRR型抗性基因簇

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Two sequence-tagged site (STS) markers for the wheat yellow rust resistance (R) gene Yr5 have been derived through the identification and characterization of linked amplified fragment length polymorphisms (AFLPs). The sequences of the 2 AFLP markers partially overlap with one another, but belong to discrete loci: S19M93-140 completely cosegregates with Yr5, whereas S23M41-310 maps at a distance of 0.7 cM. The DNA sequence of S23M41-310 shows significant homology with the 3′ end of nucleotide-binding site (NBS)- leucine-rich repeat (LRR)- type R-genes, in particular with orthologues of the rice bacterial blight R-gene Xa-I. The distinct genetic location of the 2 AFLP loci suggests that Yr5 falls within an R-gene cluster. Because neither sequence forms part of a detectable transcription product, we propose that the Yr5 R-gene cluster includes R-gene analogues and pseudogenes. A Yr5 flanking simple sequence repeat (SSR) marker has also been identified, which allows Yr5 to be effectively incorporated, along with other R-genes for yellow rust, into elite wheat genetic backgrounds, through marker-assisted selection.Deux marqueurs de séquence connue («STS») pour le gène Yr5, lequel confère la résistance (R) à la rouille jaune chez le blé, ont été dérivés via l'identification et la caractérisation de marqueurs AFLP liés. Les séquences des deux marqueurs AFLP se chevauchaient partiellement, mais provenaient de deux locus distincts puisque S19M93-140 montrait une parfaite co-ségrégation avec le gène Yr5 tandis que l'autre, S23M41-310, était situé à 0,7 cM. La séquence d'ADN de S23M41-310 montrait une homologie significative avec l'extrémité 3′ de gènes R de type NBS-LRR, particulièrement les orthologues de Xa-I, un gène de résistance à la brûlure bactérienne du riz. Le fait que les deux locus AFLP occupent des locus différents suggère que Yr5 est situé au sein d'un amas de gènes R. Comme aucune des deux séquences n'est détectable sous forme de transcrit, les auteurs proposent que l'amas de gènes R autour de Yr5 comprend des analogues de gènes de résistance (RGA) et des pseudogènes. Un marqueur SSR bordant Yr5 a aussi été identifié ce qui permet d'incorporer facilement Yr5, ainsi que d'autres gènes de résistance à la rouille jaune, au sein de lignées élites par sélection assistée (MAS).
机译：通过鉴定和鉴定连锁的扩增片段长度多态性（AFLP），获得了小麦黄锈病抗性（R）基因Yr5的两个序列标记位点（STS）标记。 2个AFLP标记的序列彼此部分重叠，但属于离散的基因座：S19M93-140与Yr5完全共聚，而S23M41-310的映射距离为0.7 cM。 S23M41-310的DNA序列与核苷酸结合位点（NBS）-富含亮氨酸的重复序列（LRR）-型R基因的3'端具有显着同源性，特别是与水稻白叶枯病R基因Xa的直向同源物-一世。 2个AFLP基因座的独特遗传位置表明Yr5属于R基因簇。因为这两个序列都不构成可检测的转录产物的一部分，所以我们建议Yr5 R基因簇包括R基因类似物和假基因。还鉴定了一个Yr5侧翼简单序列重复（SSR）标记，该标记可以通过标记辅助选择有效地将Yr5以及其他用于黄锈病的R基因掺入到优质小麦的遗传背景中。 （«STS»）倒入第5年级大学，通过RL'identification et lacaractérisationde marqueurs AFLPliés来获得réuelconfèrela ressistance（R）àrouille jaune chez leblé，法定继承人AFLP的法定参保人身份，主要法定身份的原住民法院与众不同的法院S19M93-140同一性的共同特征AVEC LeGèneYr5 tandis que l'autre，S23M41-310，ééits7。 LaSéquenced'ADN de S23M41-310具有代表性的同源性3'deNèsR de NBS-LRR类型，Xa-I的直系同源物，bréluebactériennedurizé的直系同源物。地方法人资格优先咨询委员会第5年就读的建议就读于法国马萨诸塞州R. Comme aucune des deuxséncencesin theestétectablesous forme de transcrit，les guteursRésantnt yr5自动化工具包括抵抗力的类似物（RGA）和假伪造物。 Un marqueur SSR优等生Yr5成为澳大利亚公司法人身份的Yr5，ainsi que d'autresgènesde resistanceàla rouille jaune，au sein delignéesélitesparsélectionaidé（MAS）。

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