Data bank struggles as protein imaging ups its game

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Data bank struggles as protein imaging ups its game

机译：随着蛋白质成像技术的发展，数据库正在苦苦挣扎

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Structural biology, the mapping of complex biological molecules such as proteins, is in the grip of a revolution. The field has long been dominated by X-ray crystallography, a technique made iconic by its role in decoding the DNA double helix in the 1950s. But the need to tackle more complex structures and to watch 'molecular machines' function in real time is fuelling a shift towards hybrid imaging methods that can create moving models. That is posing a challenge for the world's official repository for protein structures: the Protein Data Bank (PDB), which relies almost exclusively on crystallography data and lacks the standards and software infrastructure to archive structures described by hybrid methods. This month, leaders of the four organizations around the world that host the data bank held a workshop in Hinxton, UK, to hatch a plan to ensure that hybrid models and their insights into fundamental biology and disease do not get lost.

机译：结构生物学，即诸如蛋白质之类的复杂生物分子的图谱，正处于一场革命的掌控之中。长期以来，X射线晶体学一直占据着这个领域，X射线晶体学由于在1950年代解码DNA双螺旋结构中的作用而具有代表性。但是，需要处理更复杂的结构并实时观察“分子机器”的功能，这促使人们转向可以创建移动模型的混合成像方法。这对世界上官方的蛋白质结构储存库构成了挑战：蛋白质数据库（PDB）几乎完全依赖于晶体学数据，并且缺乏用于归档通过混合方法描述的结构的标准和软件基础结构。本月，托管数据库的全球四个组织的领导人在英国欣克斯顿举行了研讨会，以制定一项计划，以确保混合模型及其对基本生物学和疾病的见识不会丢失。

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来源
《Nature》 |2014年第7523期|416-416|共1页
作者
EWEN CALLAWAY;
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收录信息美国《科学引文索引》(SCI);美国《工程索引》(EI);美国《生物学医学文摘》(MEDLINE);美国《化学文摘》(CA);
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