• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文期刊>Nature >Next-generation characterization of the Cancer Cell Line Encyclopedia
【24h】

Next-generation characterization of the Cancer Cell Line Encyclopedia

机译：癌细胞系百科全书的下一代表征

获取原文
获取原文并翻译 | 示例
           
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

Large panels of comprehensively characterized human cancer models, including the Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE), have provided a rigorous framework with which to study genetic variants, candidate targets, and small-molecule and biological therapeutics and to identify new marker-driven cancer dependencies. To improve our understanding of the molecular features that contribute to cancer phenotypes, including drug responses, here we have expanded the characterizations of cancer cell lines to include genetic, RNA splicing, DNA methylation, histone H3 modification, microRNA expression and reverse-phase protein array data for 1,072 cell lines from individuals of various lineages and ethnicities. Integration of these data with functional characterizations such as drug-sensitivity, short hairpin RNA knockdown and CRISPR-Cas9 knockout data reveals potential targets for cancer drugs and associated biomarkers. Together, this dataset and an accompanying public data portal provide a resource for the acceleration of cancer research using model cancer cell lines.
机译：全面表征人类癌症模型的大面板，包括癌细胞系百科全书（CCLE），提供了一种严格的框架，用于研究遗传变异，候选目标和小分子和生物治疗方法，并确定新的标记驱动癌症依赖性。为了提高我们对患有癌症表型的分子特征的理解，包括药物反应，在这里，我们已经扩大了癌细胞系的特征，包括遗传，RNA剪接，DNA甲基化，组蛋白H3改性，微瘤表达和反相蛋白阵列来自各种谱系和种族个体的1,072条细胞系数的数据。这些数据与功能性质（如药物敏感性，短发夹RNA敲低和CRISPR-CAS9淘汰数据）的整合揭示了癌症药物和相关生物标志物的潜在目标。该数据集和附带的公共数据门户网站一起使用模型癌细胞系提供了癌症研究的加速资源。

著录项

  • 来源
    《Nature》 |2019年第7757期|503-508|共6页
  • 作者

    Ghandi Mahmoud; Huang Franklin W.; Jane-Valbuena Judit; Kryukov Gregory V.; Lo Christopher C.; McDonald E. Robert III; Barretina Jordi; Gelfand Ellen T.; Bielski Craig M.; Li Haoxin; Hu Kevin; Andreev-Drakhlin Alexander Y.; Kim Jaegil; Hess Julian M.; Haas Brian J.; Aguet Francois; Weir Barbara A.; Rothberg Michael V.; Paolella Brenton R.; Lawrence Michael S.; Akbani Rehan; Lu Yiling; Tiv Hong L.; Gokhale Prafulla C.; De Weck Antoine; Mansour Ali Amin; Oh Coyin; Shih Juliann; Hadi Kevin; Rosen Yanay; Bistline Jonathan; Venkatesan Kavitha; Reddy Anupama; Sonkin Dmitriy; Liu Manway; Lehar Joseph; Korn Joshua M.; Porter Dale A.; Jones Michael D.; Golji Javad; Caponigro Giordano; Taylor Jordan E.; Dunning Caitlin M.; Creech Amanda L.; Warren Allison C.; McFarland James M.; Zamanighomi Mahdi; Kauffmann Audrey; Stransky Nicolas; Imielinski Marcin; Maruvka Yosef E.; Cherniack Andrew D.; Tsherniak Aviad; Vazquez Francisca; Jaffe Jacob D.; Lane Andrew A.; Weinstock David M.; Johannessen Cory M.; Morrissey Michael P.; Stegmeier Frank; Schlegel Robert; Hahn William C.; Getz Gad; Mills Gordon B.; Boehm Jesse S.; Golub Todd R.; Garraway Levi A.; Sellers William R.;

  • 作者单位

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA|Univ Calif San Francisco San Francisco CA 94143 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA|Girona Biomed Res Inst IDIBGI Girona Spain;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Massachusetts Gen Hosp Ctr Canc Boston MA USA|Massachusetts Gen Hosp Dept Pathol Boston MA 02114 USA|Harvard Med Sch Boston MA 02115 USA;

    Univ Texas MD Anderson Canc Ctr Houston TX 77030 USA;

    Univ Texas MD Anderson Canc Ctr Houston TX 77030 USA;

    Belfer Ctr Appl Canc Sci Boston MA USA;

    Belfer Ctr Appl Canc Sci Boston MA USA;

    Novartis Inst Biomed Res Basel Switzerland;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    New York Genome Ctr New York NY USA|Weill Cornell Med Inst Computat Biomed Englander Inst Precis Med Dept Pathol & Lab Med New York NY USA|Weill Cornell Med Meyer Canc Ctr New York NY USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA|NCI Rockville MD USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Basel Switzerland;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    New York Genome Ctr New York NY USA|Weill Cornell Med Inst Computat Biomed Englander Inst Precis Med Dept Pathol & Lab Med New York NY USA|Weill Cornell Med Meyer Canc Ctr New York NY USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Massachusetts Gen Hosp Ctr Canc Boston MA USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA;

    Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Massachusetts Gen Hosp Ctr Canc Boston MA USA|Massachusetts Gen Hosp Dept Pathol Boston MA 02114 USA|Harvard Med Sch Boston MA 02115 USA;

    Univ Texas MD Anderson Canc Ctr Houston TX 77030 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA|Howard Hughes Med Inst Chevy Chase MD USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Dana Farber Canc Inst Dept Med Oncol Boston MA 02115 USA;

    Broad Inst MIT & Harvard Cambridge MA 02142 USA|Novartis Inst Biomed Res Cambridge MA 02139 USA;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《工程索引》(EI);美国《生物学医学文摘》(MEDLINE);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号