...
  • 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文期刊>Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America >Sampling motifs on phylogenetic trees
【24h】

Sampling motifs on phylogenetic trees

机译：系统发育树上的采样图案

获取原文
获取原文并翻译 | 示例
           
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

We present a method to find motifs by simultaneously using the overrepresentation property and the evolutionary conservation property of motifs. This method is applicable to divergent species where alignment is unreliable, which overcomes a major limitation of the current methods. The method has been applied to search regulatory motifs in four yeast species based on ChIp-chip data in Saccharomyces cerevisiae and obtained 20% higher accuracy than the best current methods. We also discovered cis-regulatory elements that govern the tight regulation of ribosomal protein genes in two distantly related insects by using this method. These results demonstrate that our method will be useful for the extraction of regulatory signals in multiple genomes.
机译：我们提出了一种通过同时使用图案的过分表现性质和进化保守性来寻找图案的方法。该方法适用于对齐不可靠的发散物种，从而克服了当前方法的主要局限性。该方法已被用于基于酿酒酵母中ChIp芯片数据搜索四种酵母物种的调控基序，并且比目前的最佳方法获得了20％的更高准确度。通过使用此方法，我们还发现了顺式调控元件，可控制两个遥远相关昆虫中核糖体蛋白基因的严格调控。这些结果表明，我们的方法将可用于提取多个基因组中的调控信号。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号