Si MSD est fier de la qualité de sa recherche interne, une grande partie de l'innovation qui l'intéresse est trouvée à l'extérieur de l'entreprise. L'Europe, et en particulier la France, continue d'être un moteur scientifique de premier ordre. Pour cette raison, MSD a placé dans plusieurs villes européennes (dont Paris) une petite équipe dont la tâche est d'entretenir des relations étroites avec le monde académique et les petites entreprises pharmaceutiques et biotechs locales.
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