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H-REPRESENTATION OF THE KIMURA-3 POLYTOPE FOR THE m-CLAW TREE

机译:m-Claw树的KIMURA-3多边形的H表示

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摘要

Given a group-based Markov model on a tree, one can compute the vertex representation of a polytope describing a toric variety associated with the algebraic statistical model. In the cases of Z(2) and Z(2) X Z(2), these polytopes have applications in the field of phylogenetics. We provide a half-space representation of the polytope for the m-claw tree where G = Z(2) x Z(2). This choice of group corresponds to the Kimura-3 model of evolution.
机译:给定一棵树上基于组的马尔可夫模型,就可以计算多面体的顶点表示,该多面体描述与代数统计模型相关的复曲面变体。在Z(2)和Z(2)X Z(2)的情况下,这些多表位在系统发育领域具有应用。我们提供了m爪树的多义词的半空间表示,其中G = Z(2)x Z(2)。选择的组对应于进化的Kimura-3模型。

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