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Computational aspects of DNA mixture analysis

机译:DNA混合物分析的计算方面

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摘要

Statistical analysis of DNA mixtures for forensic identification is known to pose computational challenges due to the enormous state space of possible DNA profiles. We describe a general method for computing the expectation of a product of discrete random variables using auxiliary variables and probability propagation in a Bayesian network. We propose a Bayesian network representation for genotypes, allowing computations to be performed locally involving only a few alleles at each step. Exploiting appropriate auxiliary variables in combination with this representation allows efficient computation of the likelihood function and prediction of genotypes of unknown contributors. Importantly, we exploit the computational structure to introduce a novel set of diagnostic tools for assessing the adequacy of the model for describing a particular dataset.
机译:由于可能的DNA分布图的巨大状态空间,用于法医鉴定的DNA混合物的统计分析面临着计算难题。我们描述了一种通用方法,用于使用贝叶斯网络中的辅助变量和概率传播来计算离散随机变量乘积的期望值。我们提出一种用于基因型的贝叶斯网络表示法,允许在每个步骤仅在几个等位基因的情况下进行本地计算。与该表示法结合使用适当的辅助变量可以有效地计算似然函数并预测未知贡献者的基因型。重要的是,我们利用计算结构引入了一套新颖的诊断工具,用于评估用于描述特定数据集的模型的适当性。

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