В настоящее время известны три основных пути связывания мРНК с 40S субчастицей рибосом у эукариот: классический кеп-зависимый путь, шунтирующий механизм и IRES-зависимый способ инициации трансляции [см. 1]. При IRES-зави-симом способе, 40S субчастица связывается не с 5'-концом мРНК, а со специфическим внутренним участком ее 5'-НТО (Internal Ribosome Entry Site, IRES). Классический пример IRES-элементов представляют собой специфические участки связывания рибосом РНК пикорнавирусов, к которым относится и вирус энцефаломиокардита мышей (ВЭМК, группа кардиовирусов). Известно, что IRES-элементы пикорнавирусов используют те же канонические факторы инициации трансляции, что и кеп-зависимые мРНК, но, в отличие от последних, главным компонентом, узнающим IRES-элеменг, оказывается не кеп-связывающая субъединица (eIF4E) фактора инициации eIF4F, a его большая субъединица (eIF4G), обладающая РНК-связывающими свойствами (см. [2]). Третьим компонентом eIF4F является факгор eIF4A, который существует и в свободном состоянии, постоянно обмениваясь со связанным в eIF4F фактором 4А [3]. Факгор eIF4A обеспечивает разворачивание вторичной структуры РНК вблизи инициирующего кодона и, вероятно, укладку инициирующего учасгка РНК в соответствующий канал 40S рибосомной субчастицы. Фактор eIF4E связан с большой субъединицей eIF4F (eIF4G) приблизительно на расстоянии одной трети длины от ее N-конца, в то время как eIF4A связывается в двух местах eIF4G - в центре и в ее С-концевой части [4, 5]. мРНК-связывающий участок eIF4G, ответственный за первичное узнавание IRES-элементов пикорнавирусных РНК, также расположен в центральной части фактора [4]. У РНК ВЭМК и вируса ящура он взаимодействует с IRES-элементом в районе Т-К-домена [6, 7], как показано на рис. 1. Главный мотив соотвегсг-вующего узнающег о участка IRES-э лемен т а - по-следовательность 5' AAAAA(G/A) У [6], образующая внутреннюю пет лю усоединения доменов J и К. Наконец, центральная часть eIF4G имеет также участок связывания фактора инициации еШЗ, который, в свою очередь, связывается с 40S субчастицей [5]. Таким образом, первичное связывание РНК обеспечивается цепочкой взаимодействий IRES-eIF4G-eIF3-40S.
展开▼
