...
首页> 外文期刊>Молекулярная биология >ВЗАИМОСВЯЗЬ МЕЖДУ ПЛОЩАДЬЮ ДОСТУПНОЙ РАСТВОРИТЕЛЮ ПОВЕРХНОСТИ БЕЛКА И ЧИСЛОМ НАТИВНЫХ КОНТАКТОВ В ЕГО СТРУКТУРЕ
【24h】

ВЗАИМОСВЯЗЬ МЕЖДУ ПЛОЩАДЬЮ ДОСТУПНОЙ РАСТВОРИТЕЛЮ ПОВЕРХНОСТИ БЕЛКА И ЧИСЛОМ НАТИВНЫХ КОНТАКТОВ В ЕГО СТРУКТУРЕ

机译:蛋白质表面的地区经济实惠溶剂与其结构中的天然接触数之间的关系

获取原文
获取原文并翻译 | 示例
           

摘要

Степень свернутости белка по ходу сворачивания характеризуется либо площадью поверхности SASA, доступной растворителю, либо числом образованных нативных контактов N_(cont). Очевидно, что эти величины должны быть связаны друг с другом, поскольку при изменении конформации белка входе его сворачивания уменьшение S_(ASA) должно сопровождаться соответствующим увеличением числа нативных контактов. Показано, что эта взаимосвязь существует и очень сильна (коэффициент корреляции составляет более 99%), что может быть использовано для достаточно точной и быстрой оценки площади поверхности по числу нативных контактов. Среди используемых обычно способов расчета контактов наилучшее согласие наблюдается для атом-атомного способа, если принимать во внимание атомы водорода, а пороговое значение для расстояния между центрами атомов выбрать равным 8 А. Последнее означает, что для экранирования внутренней части белка от растворителя важны два слоя поверхностных атомов.
机译:折叠过程中的滚动蛋白质的特征在于SASA表面的表面,实惠的溶剂或形成的天然触点N_(续)的数量。显然,这些值应该彼此相关联,因为当蛋白质的转换改变时,其折叠减少S_(ASA)的输入必须伴随着本机触点的数量适当的增加。结果表明,这种关系存在并且非常强(相关系数超过99%),其可用于通过天然触点的数量对表面积充分准确和快速评估。在计算所用触点的方法中,如果考虑到氢原子,则观察到原子原子方法的最佳协议,以及原子之间的距离选择8a的距离的阈值。最后意味着两层表面层对于筛选蛋白质原子的内部是重要的。

著录项

获取原文

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号