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首页> 外文期刊>Journal of mass spectrometry: JMS >Matrix-dependent a/x pair and overdegraded w/y/z ions generated by radical-directed dissociation of peptide radical cations [M](+) in matrix-assisted laser desorption/ionization in-source decay
【24h】

Matrix-dependent a/x pair and overdegraded w/y/z ions generated by radical-directed dissociation of peptide radical cations [M](+) in matrix-assisted laser desorption/ionization in-source decay

机译：基质依赖性A / X对，由基质辅助激光解吸/电离中的肽自由基阳离子[M]（+）的自由基定向解离，源极衰减

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Fragmentation of peptide radical cations [M](.)(+) has been examined using matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) in-source decay (ISD) with hydrogen-abstracting nitro-substituted matrices. The ISD spectra of peptides containing an arginine (Arg) residue at carboxyl (C)-termini showed preferential [w](+) ions when 4-nitro-1-naphthol (4,1-NNL) matrix was used, whereas the use of 3,5-dinitrosalicylic acid (3,5-DNSA) resulted in preferential [x](+) ions. Minor or some [d](+), [x](+), [y](+), and [z](+) ions were also observed. For peptides containing Arg residue at amino (N)-termini, the ISD spectra showed preferential [a](+) ions independent of matrix used. The observed [a](+), [w](+), [x](+), [y](+), and [z](+) ions can be rationally explained by radical-directed dissociation (RDD) of the peptide radical cations [M](.)(+), although [d](+) ions may be formed via Norrish Type I cleavage and/or by RDD of [M](.)(+) ions. The formation of overdegraded [d](+), [w](+), [y](+), and [z](+) ions is discussed from the standpoint of the internal energy of radical cations [M](.)(+) and radical fragment ions [a + H](.)(+) and [x + H](.)(+) deposited via collisional interactions with excited matrix molecules in the MALDI plume. The radical site of the peptide cations [M](.)(+) was presumed to be backbone amide nitrogen, from MALDI-ISD data with three different deuterated amino acids.
机译：肽基阳离子的碎片[M]（.）（+）已通过氢提取硝基取代基质，在源衰变（ISD）中使用基质辅助激光解吸/电离（MALDI）进行检测。当使用4-硝基-1-萘酚（4,1-NNL）基质时，羧基（C）-末端含有精氨酸（Arg）残基的肽的ISD光谱显示出优先[w]（+）离子，而使用3,5-二硝基水杨酸（3,5-DNSA）则产生优先[x]（+）离子。还观察到少量或部分[d]（+），[x]（+），[y]（+）和[z]（+）离子。对于氨基（N）-末端含有Arg残基的肽，ISD光谱显示出与所用基质无关的优先[a]（+）离子。观察到的[a]（+）、[w]（+）、[x]（+）、[y]（+）和[z]（+）离子可以用肽基阳离子[M]（.）的自由基定向离解（RDD）合理地解释（+），尽管[d]（+）离子可以通过诺里斯I型裂解和/或[M]（.）的RDD形成（+）离子。从自由基阳离子[M]（.）内能的角度讨论了过度降解[d]（+）、[w]（+）、[y]（+）和[z]（+）离子的形成（+）和自由基碎片离子[a+H]（）（+）和[x+H]（）（+）通过与MALDI羽流中激发的基质分子碰撞作用沉积。肽阳离子的自由基位点[M]（.）根据含有三种不同氘化氨基酸的MALDI-ISD数据，推测（+）为主链酰胺氮。

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