ex vivo T細胞除去を用いた移植法：GVHDの発症率を低下させることが可能であるが，高い拒絶率，再発率，感染症の克服が課題である．大量CD34陽性細胞移植法：拒絶率は低下したが，依然として高い移植関連死亡率,ドナーへの身体的負担も問題である抗胸腺細胞免疫グロブリン（anti－thymocyte globulin：ATG）やモノクローナル抗体を用いたin vivoT細胞除去：移植片の処理が不要である利点があり，新規プロトコールの開発が期待される．ドナーT細胞にex vivoでアナジーを誘導する移植法：細胞プロセシングのための設備を必要とするが，感染免疫への影響が少ない可能性がある．母子間マイクロキメリズムを指標とした移植：他の方法と比較して,重篤なGVHDの発生頻度が高い点に課題がある.
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