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Selection and Evaluation of Appropriate Reference Genes for RT-qPCR Normalization of Volvariella volvacea Gene Expression under Different Conditions

机译：不同条件下volvariella volvacea基因表达的适当参考基因的选择与评价

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Volvariella volvacea (V. volvacea), commonly referred to as Chinese (paddy straw) mushroom, is a basidiomycete with a protein-rich volva and pileus. Selecting appropriate reference genes is a crucial step in the normalization of quantitative real-time PCR data. Therefore, 12 candidate reference genes were selected from the V. volvacea transcriptome based on previous studies and then BestKeeper, geNorm, and NormFinder were used to identify reference genes stably expressed during different developmental stages and conditions. Of the 12 candidate reference genes, SPRY domain protein (SPRYp), alpha-tubulin (TUBα), cyclophilin (CYP), L-asparaginase (L-asp), and MSF1-domain-containing protein (MSF1) were the most stably expressed under different experimental conditions, while 18S ribosomal RNA (18S), 28S ribosomal RNA (28S), and beta-actin (ACTB) were the least stably expressed. This investigation not only revealed potential factors influencing the suitability of reference genes, but also identified optimal reference genes from a pool of candidate genes under a wide range of conditions.
机译：Volvariella volvacea（V.Volvacea），通常称为中文（稻草）蘑菇，是一种含有蛋白质丰富的volva和菌落的基础菌网。选择合适的参考基因是定量实时PCR数据的归一化的关键步骤。因此，基于先前的研究，从V.Volvacea转录组中选择12个候选参考基因，然后使用BESTKEEKER，GENORM和NARMFINDER来鉴定在不同发育阶段和条件下稳定表达的参考基因。在12个候选基因，SPry结构域蛋白（SpryP），α-微管蛋白（管蛋白），环托酚（CYP），L-天冬酰胺酶（L-ASP）和MSF1-域的蛋白质（MSF1）是最稳定的表达的在不同的实验条件下，虽然18S核糖体RNA（18S），28S核糖体RNA（28s）和β-肌动蛋白（ACTB）是最稳定的表达的。本研究不仅揭示了影响参考基因适用性的潜在因素，而且还在广泛的条件下从候选基因库中鉴定出最佳参考基因。

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