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首页> 外文OA文献 >Insertion Preference of Maize and Rice Miniature Inverted Repeat Transposable Elements as Revealed by the Analysis of Nested Elements W
【2h】

Insertion Preference of Maize and Rice Miniature Inverted Repeat Transposable Elements as Revealed by the Analysis of Nested Elements W

机译：玉米和水稻微型倒置重复转换元素的插入偏好，如嵌套元素的分析所揭示的W

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摘要

A 128-bp insertion into the maize waxy-B2 allele led to the discovery of Tourist, a family of miniature inverted repeat transposable elements (MITEs). As a special category of nonautonomous elements, MITEs are distinguished by their high copy number, small size, and close association with plant genes. In maize, some Tourist elements (named Tourist-Zm) are present as adjacent or nested insertions. To determine whether the formation of multimers is a common feature of MITEs, we performed a more thorough survey, including an estimation of the proportion of multimers, with 30.2 Mb of publicly available rice genome sequence. Among the 6600 MITEs identified, >10% were present as multimers. The proportion of multimers differs for different MITE families. For some MITE families, a high frequency of self-insertions was found. The fact that all 340 multimers are unique indicates that the multimers are not capable of further amplification.
机译：128bp插入玉米蜡质-B2等位基因导致了游客的发现，一系列微型倒置重复转换元素（螨虫）。作为非自治元素的特殊类别，螨虫通过其高拷贝数，体积小，与植物基因密切相关。在玉米中，一些旅游元素（名为Tourist-ZM）作为相邻或嵌套的插入存在。为了确定多方面的形成是螨虫的常见特征，我们进行了更彻底的调查，包括估计多数量的比例，具有30.2 MB的公共水稻基因组序列。在鉴定的6600次螨中，> 10％作为多聚体存在。多米表的比例不同于不同的螨虫。对于一些螨虫族，发现了高频的自我插入。所有340个多数人都是唯一的事实表明多方面不能进一步放大。

著录项

  • 作者

    Ning Jiang; Susan R. Wessler;

  • 作者单位
  • 年度 2001
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
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