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一种精神分裂症基因-基因互作网络及其构建方法

摘要

本发明公开了一种精神分裂症基因‑基因互作网络的构建方法,所述构建方法包括以下步骤:①收集已知精神分裂症候选基因;②将上述收集的已知精神分裂症候选基因映射在人类蛋白质‑蛋白质互作网络,转换成以基因命名的相互作用网络;③对网络中的所有基因进行R‑score赋值,对网络中的所有基因进行G‑score赋值,对每条边赋予权重;④构造节点间最短路径矩阵;以“游走扩展”法提取初步网络;⑤提取最终网络,输出结果。本发明构建精神分裂症基因‑基因互作网络移除了部分假阳性基因,囊括进来了更多的与精神分裂症相关的潜在候选基因,富集分析结果表明,保留的基因与精神分裂症更相关,表明本发明构建的基因互作网络质量更优。

著录项

  • 公开/公告号CN110827916A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-02-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南方医科大学南方医院;

    申请/专利号CN201911021952.0

  • 申请日2019-10-24

  • 分类号

  • 代理机构广州三环专利商标代理有限公司;

  • 代理人颜希文

  • 地址 510515 广东省广州市广州大道北路1838号

  • 入库时间 2023-12-17 07:47:18

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-03-17

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/00 申请日:20191024

    实质审查的生效

  • 2020-02-21

    公开

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