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一种蜘蛛线粒体COIII基因全序列扩增引物及鉴定方法

摘要

本发明公开了一种蜘蛛的线粒体 COIII 基因全序列扩增引物,并利用其全序列测序信息快速鉴定蜘蛛种类的方法,包括蜘蛛基因组总DNA的提取,COIII基因全序列扩增引物的设计,PCR扩增,测序以及基于 COIII 基因全序列进行蜘蛛种类的快速鉴定。采用本发明的通用扩增引物可以快速高效地扩增多种蜘蛛的线粒体COIII基因的全序列,为蜘蛛种类的快速鉴定,种群多样性分析,种质资源保护利用等研究提供一种有力的工具,也为蜘蛛线粒体全基因组测序和不同分类阶元系统进化的分析研究奠定基础。

著录项

  • 公开/公告号CN104450699A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2015-03-25

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国计量学院;

    申请/专利号CN201410753854.7

  • 发明设计人 王正亮;俞晓平;李超;

    申请日2014-12-11

  • 分类号C12N15/11(20060101);C12Q1/68(20060101);

  • 代理机构33200 杭州求是专利事务所有限公司;

  • 代理人张法高

  • 地址 310013 浙江省杭州市下沙高教园区学源街

  • 入库时间 2023-12-18 08:00:51

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-09-26

    授权

    授权

  • 2015-04-22

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N15/11 申请日:20141211

    实质审查的生效

  • 2015-03-25

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域,具体涉及一种蜘蛛线粒体细胞色素C氧化酶3 (cytochrome oxidase subunits 3; COIII) 基因全序列的扩增引物及鉴别蜘蛛种类的方法。

背景技术

    蜘蛛是一种重要的害虫捕食性天敌,在害虫综合防治过程中具有重要的作用和地位。注意保护种库,促进天敌群落重建,能有效的控制诸多农业害虫,诸如飞虱、叶蝉、螟虫、棉蚜等的发生和危害。快速而准确的物种鉴定是蜘蛛保护和利用的研究的必要前提和基础。然而,基于外观形态及解剖特征的传统分类鉴定方法不仅耗时耗力,而且对鉴定人员的专业知识要求较高,常受主观因素的干扰,极易混淆出错。另一方面,蜘蛛种类繁多,对其开展区系分类研究也极为重要,这对蜘蛛种质资源有效保护利用具有重要意义。

    近年来,随着分子生物学技术的快速发展,利用DNA序列(分子标记)对物种进行分类鉴定和系统发育分析已经成为一种简单高效的方法。线粒体基因组DNA具有母系遗传,拷贝数多,重组率低,进化速度较快等优点,所以成为物种鉴定和研究物种进化关系的理想选择。包括蜘蛛在内的节肢动物线粒体基因组DNA一般由13个蛋白质基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因(12S rRNA和16S rRNA)共37个编码基因及一段非编码区(控制区)组成。其中细胞色素C氧化酶亚基I (COI)基因已作为公认的分子标记,广泛应用于节肢动物的群体遗传学,系统发生学及保护生物学等研究领域。COIII作为线粒体蛋白质编码基因中3个编码细胞色素C氧化酶复合体亚基基因之一,进化速率适中,亦可作为重要的遗传分子标记。然而,目前针对种类繁多,具有重要利用价值的蜘蛛的线粒体COIII基因的通用扩增引物则未曾报道。缺乏扩增效率高的通用引物严重阻碍了COIII基因作为分子标记的应用,因此设计特异性扩增蜘蛛线粒体COIII基因的通用引物,对利用分子方法快速鉴定蜘蛛物种和进行种类多样性调查分析具有重要的意义,同时也为蜘蛛线粒体全基因组序列测定和系统进化分析奠定了基础。

发明内容

本发明的目的是克服现有技术的不足,提供一种一种蜘蛛线粒体COIII基因全序列扩增引物及鉴定方法。

为实现本发明的目的,发明人提供以下技术方案:

本发明首先提供了一对蜘蛛线粒体COIII基因全序列的通用扩增引物,这对引物是根据GenBank数据库中已经公布的蜘蛛线粒体全基因组序列设计的,正向引物 COIII-F如SEQ ID NO:1所示,反向引物 COIII-R如SEQ ID NO:2所示:

SEQ ID NO:1: 5′- ATGTTCTGAAATTTGTGGT -3′;

   SEQ ID NO:2: 5′- TACTACATCTACAAAATGTC -3′。

利用上述一对蜘蛛线粒体COIII基因全序列扩增引物,PCR扩增测序后可实现对蜘蛛种类的快速鉴定。具体包括以下步骤:

 (1) 采用DNA抽提试剂盒提取蜘蛛的总基因组DNA。为避免污染,舍去头腹部,只从腿部提取DNA。

 (2) 利用上述的一对引物,以抽提好的蜘蛛基因组为模板,进行 PCR 扩增和测序(结果见图1)。PCR 反应体系为 50μ1,其中:2μl模板 DNA (约20ng),5μl 10×PCR buffer,4μl 2.5mM MgCl2, 1μl 10 mM dNTPs,各1μl 10 mM正、反向引物,0.5μl 5U/μl  TaqDNA聚合酶,加去离子水调至终体积50μ1;PCR反应条件为:95°C预变性3分钟,94°C变性30秒,50°C退火30秒,72°C延伸2分钟;35个循环后,72°C再延伸7分钟。

(3) PCR产物测序,对测序结果进行处理分析,截取COIII基因全序列,使用ClustalX软件进行DNA序列比对。达到物种鉴定的目的。

作为优选,本发明所述的鉴定方法中,其中步骤(1)所述的蜘蛛种类包括但不限于下述:拟水狼蛛(Pirata subpiraticus),三突花蛛(Ebrechtella tricuspidata),横纹金蛛(Argiope bruennichi),锥腹肖蛸(Tetragnatha maxillosa),华丽肖蛸(Tetragnatha nitens),茶色新圆蛛(Neoscona theisi)、脉娲蛛(Wadicosa venatrix)、黑色蝇虎(Plexippus paykulli),大腹园蛛(Araneus ventricosus)、猫跳蛛(Carrhotus xanthogramma)。

本发明的优点是:

1. 本发明提供的蜘蛛线粒体COIII基因扩增引物,可以高效特异(条带单一)的扩增多种蜘蛛的线粒体COIII基因的全序列,而不仅仅是部分序列,能应用于蜘蛛不同分类阶元系统进化和分类研究;

2. 该方法所述的物种鉴定方法可以对多种蜘蛛进行准确鉴定,且不受发育阶段和个体残缺的限制,大大克服了形态鉴定的困难,缩短了鉴定的周期;该种蜘蛛的分子生物学鉴别方法对使用的仪器设备要求较低,且无需复杂的技术步骤和昂贵的试剂,一般的技术人员均可操作,比传统的形态学鉴别更准确可靠。

附图说明

图1为本发明中蜘蛛线粒体COIII基因扩增引物用以扩增不同种类蜘蛛线粒体COIII基因的电泳图谱。

其中,M: DNA分子量标准(Mark IV);1-10泳道依次为拟水狼蛛,三突花蛛,横纹金蛛,锥腹肖蛸,华丽肖蛸,茶色新圆蛛、脉娲蛛、黑色蝇虎,大腹园蛛,猫跳蛛。

具体实施方式

下面结合具体实施例,进一步阐述本发明

实施例1:

(1) 蜘蛛样品的采集,鉴定及保存

    实施例中所用蜘蛛种类均用陷阱法采自浙江省余姚市或桐乡县农田。所采标本带回实验室进行信息登记,均用体视显微镜鉴定,以确定种类,蜘蛛标本用100%的酒精浸泡并保存于4°C冰箱备用。所采集的蜘蛛种类包括:拟水狼蛛,三花突蛛,横纹金蛛,锥腹肖蛸,华丽肖蛸,茶色新圆蛛、脉娲蛛、黑色蝇虎,大腹园蛛、猫跳蛛。

蜘蛛基因组总DNA的提取

采用DNA抽提试剂盒提取不同种类蜘蛛的总基因组DNA 。为避免污染,舍去头腹部,只从腿部提取DNA。DNA提取直接利用 DNA抽提试剂盒(天根生化科技有限公司)提取。提取的总基因组–20°C保存备用。

设计合成蜘蛛线粒体COIII基因全序列的扩增引物

登陆NCBI网站中的GenBank数据库收索已公布的蜘蛛全线粒体基因组序列,经ClustalW软件同源比对,找出COIII基因上下游保守的序列,利用Premier primer 5.0 软件设计出蜘蛛线粒体COIII基因全序列扩增引物并送南京金斯瑞生物科技有限公司合成。正向引物 COIII-F如SEQ ID NO:1所示,反向引物 COIII-R如SEQ ID NO:2所示:

SEQ ID NO:1: 5′- ATGTTCTGAAATTTGTGGT -3′;

   SEQ ID NO:2: 5′- TACTACATCTACAAAATGTC -3′。

PCR扩增线粒体COIII基因全序列和序列测定

利用上述的一对引物,以抽提好的蜘蛛基因组为模板,进行 PCR 扩增。其中,PCR 反应体系为 50μ1,其中:2μl模板 DNA (约20ng),5μl 10×PCR buffer,4μl 2. 5mM MgCl2, 1μl 10 mM dNTPs,各1μl 10 mM正、反向引物,0.5μl 5U/μl  TaqDNA聚合酶,加去离子水调至终体积50μ1;

PCR反应条件为:95°C预变性3分钟,94°C变性30秒,50°C退火30秒,72°C延伸2分钟;35个循环后,72°C再延伸7分钟。

PCR产物用1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳检测(结果见图1),扩增片段用凝胶回收试剂盒(天根生化科技有限公司)割胶回收。回收产物送南京金斯瑞生物科技有限公司测序。

依据COIII全序列信息快速确定蜘蛛的种类。

对上一步测序结果进行处理分析,截取COIII序列,用ClustalX软件进行序列信息比对,进行物种鉴定。

蜘蛛的COIII基因全序列如下:

拟水狼蛛的COIII基因全序列如SEQ ID NO:3所示:

TTGGAAAAGCATTATCATCCTTTTCATATAGTAAATATATCACCTTGACCTTTAGTAACAGGATTTGGAGCATTATTTATAGTTATTGGAATAATTAAAATATTTATATTTTATGATGTTAGATTATTATTATTTTCTTTTGTTATATTATTTGTAGTAGCTATATTATGGTGACGAGATGTAATTCGAGAAAGAACCTTTCAGGGATTCCATTCAAGAATTGTATTAAAAGGGTTGATAGTAGGTATAGTTTTATTTATTGTAAGAGAAATTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTGGGCCTTTTTTCATTCTAGACTAAGACCTACAATTGAATTAGGGTCTTATTGACCTCCAATGGGAATTCATACTTTTAATCCTTTTCAGGTTCCTTTATTAAATACTGTAATTTTATTGTCCTCAGGGGTAAGAGTAACTTGGGCTCATCAGCTTATTTTAAGGGAAGATTGATATGGAGTTGAGATTTCTTTAATAATAACTTGATTGTTAGGATTATATTTTTTAATATTACAAGGGTTTGAATATTATATATCTTCTGTTAGAATTAGAGATTCTGTTTTTGGATCTACTTTTTTTATGTCTACTGGTTTTCATGGATTTCATGTTATTGTTGGTACTTTATTTTTGTTTATTATTTGAATTCGTTTTTTAAATAGACATTTTTCTGGGGGGCATCACTTTGGATTTGAGGCTGCTGTATGATATTGACATTTTGTAGATGTAGTATGATTATTTTTATTTTCTGTTGTTTACTGATGGGGGTCTTAA;

三花突蛛COIII基因全序列如SEQ ID NO:4所示:

TTGGAAAGGCATTATCATCCTTTTCATATAGTTAATATATCCCCTTGACCTTTAATAAGAGGGTTTACAGCTTTGGCTGTGGTTTCAGGTATAATTAAAATGTTTGCGTATTATGATTTTAATTTATTTTTATTTTCTTTTTTTGTGTTAATTTTGGTAGCTTTTTCTTGATGGCGAGATGTAGTACGGGAAAGAACTTATCAGGGATTTCATTCTAGAATAGTGTTAAATGGTTTGATTTGGGGTATGATTTTGTTTATTGTTAGAGAGATTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTGGGGATTTTTTCATTCTAGATTGAGACCTTCTATTGAATTAGGATCTCAATGACCTCCTATAGGGGTTTTTTCTTTAAATCCTTTTCAAGTTCCTCTTTTAAATACTATTATTTTATTATCTTCGGGAGTTAGAGTTACTTGGTGCCATCAAATAATTTTAAATGAAAATTGAGATAGAGCTAAATCTTCTTTAATATTAACTTGAATTTTAGGAATTTATTTTTTAATACTTCAAGGATTTGAATATTATATAAGATCTTTTAGAATTAGAGATTCTAGATTTGGTTCAGTTTTTTTTATAGCTACAGGATTTCATGGTTTTCATGTAATTGTAGGTACTTTATTTTTATTTGTAATTTGAACACGATTTAATAGGGAGCATTTTTCTAGAAGTCATCATTTTGGTTTTGAAGCTGCTGCTTGGTATTTGACATTTTGTAGATGTAGTATGATTATTTTTGTTTTCTGTAGTATATTGATGGGGAACT;

横纹金蛛COIII基因全序列如SEQ ID NO:5所示:

TTGGAAAAGACATTTCATCCATTTCATATTGTAACAATTTCTCCGTGGCCTTTATTAATAGGGTTTGGAGTTATATCAGGAGTAATTGGAATAGTAAAAATATTTATATTTATAAAGTTTGATTTGTTATTTTTATCATTTTTAATTGCTGGAATAGTAGCGTTTGGATGATGACGGGATGTAGTTCGTGAAAGAACATTTCAAGGATATCATTCTAGAAATGTTTTGAGAGGATTAATGTTAGGAATAATTTTATTTATTGTAAGTGAGGTTTTCTTTTTTTTATCTTTTTTCTGGGCATTTTTTCATGCGAGATTAAATCCTACTGTAGAGTTAGGCGTAATATGACCTCCCCAGGGAATTAAGGCTTTTAGACCATTTCAAGTTCCCTTATTAAATACAGTGATTTTGTTAGCATCTGGTGTGTCAGTTACTTGAGCTCATCAATCTATTTTAAATGAAAATTGAAAAATAGCAAATTATTCTTTAATAATAACTTGAATATTAGGAATTTATTTTTTATCTTTACAAGGCTTTGAATATTATATAGCAGAATTTAGAATTTCTGATTCTGTATTTGGTTCCGTATTTTTTATAGCAACAGGGTTTCATGGATTTCATGTAATTGTAGGAAGGCTATTTTTATTTTTTATATGAGTTCGTTTAACAAAGAGACATTTTAGAAGAAGCCATCATTTTGGGTTTGAATGTGCTGCTTGATATTGACATTTTGTTGATGTAGTGTGATTATTTTTATTTTCAGTAGTTTATTGATGAGGGACTTAA;

锥腹肖蛸COIII基因全序列如SEQ ID NO:6所示:

TTGTCAAAAGTTTTTCATATATACCATATAGTAAATGTCTCTCCTTGACCATTTTTAATGGGGTCTGCTTCTTTAAGAGTAGTTCTAGGACTAGTTAAAATATTTGTTTTTTATAGATTTAAATCTTTTTTTTTCTCTCTTTTTTGTGTGGGTTTGGTGTTTCTTTTATGAGAAAAGGATGTGGTTCGAGAGAGAACTTTTCAAGGATTTCATTGTAGCCGAGTAGTAAGAGGATTAATTTATGGGATGATTTTATTTATTGTTAGAGAAGTATTTTTTTTTATTTCATTTTTCTGAACTTTTTTTCATTCTAGTTTAAACCCTGTAACAGATTTAGGGGCTGTTTGACCCCCCATAGGGATTTCCCCTTTAAATCCTTTTAGAGTTCCTTTGTTAAATACTGTAGTTTTATTAGCATCTGGGGTATCAATTACTTTATGTCATCAAGGTATTATCAATGAAGATTGAAAAAAAAGAATTTTGTCTTTAGGTATAACTTGGGGGTTAGGGTTATATTTTTTAATATTACAATATTTTGAGTATAAAATAGCAGGGTTTAGAATATCGGATTCTGTTTACGGATCTGTATTCTTTATATCAACAGGGTTTCATGGATTCCATGTATTAGTAGGAACTTTATTTTTAATAGTAATATTCTTTCGAATAATTAAGTCCCATTTTAGAATAAGACATCATTTAGGATTTGAATGTGCTGCTTGGTATTGACATTTTGTAGATGTAGTATGATTATTTTTATTTTCTGTTGTTTATTGATGGGGGTCTTAA;

华丽肖蛸COIII基因全序列如SEQ ID NO:7所示:

TTGATAAAAGTTTTTCATATATATCATATAGTTAATATATCCCCATGACCGTTTTTAATAGGATTCTCTGCCTTAAGAGTGGTTTTAGGATTAGTAAAGATATTCATTTTTAAAAATATAATCTCTTTTATCGCCAGAATTTGTTGTACAATTTTTATTTTCTTTTTATGGGAAAAAGATGTGGTTCGAGAGAGAACTTTTCAAGGAAATCATTGTAGACGTGTTGTTGAAGGTTTAATTTATGGTATAATTTTATTTATTGTTAGAGAAATTTTTTTTTTTCTCTCTTTTTTTTGAGCCTTTTTCCACTCAAGTTTAAATCCCGTAGTAGATTTAGGTTCAGATTGACCTCCTATAGGAATTTCCCCTCTAAACCCCTTTAGAGTTCCTTTGTTAAATACTGTGGTATTATTAGCTTCAGGGGTATCTATTACTTTTTGTCATCAGAGAATTTTAAACCAGGATTGAAAGAAAATAGTAACTTCGTTAATAGTAACTTGGGCACTTGGTCTATATTTCTTAACTTTGCAATATTTTGAATATAAAATAGCAGGATTCAGAATTTCTGATTCTGTATTTGGATCTGTATTTTTTATATCAACTGGATTTCATGGTTTCCATGTAATGGTAGGAACGGGATTTTTATTAATTATATTTATTCGAGGAATTAAGAGACATTTCAGAAGAAGTCATCATTTAGGATTTGAATGTGCTGCTTGGTATTGACATTTTGTAGATGTAGTATGGTTATTTCTATTTTCAGTAGTATATTGATGGGGTTGTTAATTTAAGTAA;

茶色新圆蛛COIII基因全序列如SEQ ID NO:8所示:

TTGGAAAAAACTTTTCATCCTTTTCATATTGTAACTATTTCACCATGGCCTTTATTAATAGGGTTTGGAGTTATATCTGGTGTTATTGGAATAATTAAGATATTTATATTTATAAAGTTTGATTTATTATCTATATCATTTTTAATTGTTGTTATAGTAGCTTTTGGGTGGTGACGAGATGTTGTTCGGGAAAGAACTTTTCAGGGATATCATTCAAGAAATGTATTAAGAGGATTAATACTAGGAATAATTTTATTCATTGTAAGAGAAGTATTTTTTTTTTTATCATTTTTTTGAGCTTTTTTTCATTCAAGATTAAATCCTACTGTAGAATTAGGTGTAATTTGACCTCCTCAGGGAATCAAGGCGTTTAGTCCATTTCAAATTCCTTTATTAAATACTATTATTTTATTAGCATCTGGGGTTTCTGTAACATGAGCTCATCAATCTATTTTAAATGAGAATTGAAAGATAGCAAATTATTCTTTAATATTAACGTGAATATTAGGCGTTTATTTTTTAGGGCTTCAAGGTTTCGAATATTATATAGCAGAATTCAGAATTTCTGATTCAGTTTTTGGATCAGTATTTTTTATAGCTACTGGATTTCATGGATTTCATGTAATTGTGGGAAGATTATTTTTATTTGTAATATGAATACGATTAACTAAGAGACATTTTAGAAGAAGTCATCACTTTGGATTTGAAAGAGCTGCTTGATACTGACATTTTGTAGATGTAGTATGGTTATTTTTATTTTCTGTAGTTTATTGATGAGGAACTTAA;

脉娲蛛COIII基因全序列如SEQ ID NO:9所示:

TTGGAAAAGCATTTTCATCCTTTTCATATAGTAAATATATCTCCTTGACCATTAGTAGTAGGATTTGGGGCTTTATTTATAGTAGTTGGAATAATTAAAATGTTTATATTTTATGATGTAAGTTTATTAATATTGTCTTTTGTAATATTATTTGTGGTAGCTATATTATGGTGGCGAGATGTAATTCGAGAAAGAACCTTTCAGGGATTCCACTCAAGAGTGGTATTGAAGGGATTGATAGTTGGTATAATTTTATTTATTGTAAGAGAAATTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGAGCTTTTTTTCATTCTAGACTTAGTCCTACAATTGAATTAGGGTCTTATTGACCTCCTATAGGTATTCATCCTTTTAATCCTTTTCAAGTGCCTTTATTAAATACTGTAATTTTACTTTCTTCAGGTGTTAGAGTAACTTGGGCTCATCAGCTTATTTTAAGGGAAGATTGGTATGGGGTTAAGATTTCTTTAATGATGACTTGATTATTGGGATTATATTTTTTAATATTACAAGGATTTGAATATTATATATCTTCTACTGGAATTAGAGATTCTGTTTTTGGATCTACTTTTTTTATATCTACTGGTTTTCATGGGTTTCATGTTATTGTTGGTACTTTATTTTTATTTATTATTTGAATTCGTTTTTTAGGTGGGCATTTTTCTGGCAGACATCATTTTGGATTTGAAGCTGCGGTTTGATATTGACATTTTGTAGATGTAGTATGATTATTTTTATTTTCTGTTGTTTATTGGTGAGGTGGATAA;

黑色蝇虎COIII基因全序列如SEQ ID NO:10所示:

TTGGAAAAGTTTTTTCATCCTTATCATATAGTAAATATGTCTCCTTGACCTTTAGTTGTTGGATTTGGGGCTATAAGAGTAGTAATTGGACTAGTTAAAATGTTCTGTTTTTTTGAGACTGATTTATTGTTTGTATCTTTATATTTAGTAGCAATAGTGGCTTTATTATGATGGCGGGATGTAATTCGGGAGAGTACATTTCAAGGTCTTCATTCTAGAATAGTTTTAAGAGGATTAATAGTAGGGATAATCTTATTTATTGTAAGAGAGGTATTTTTTTTTATTTCTTTTTTTTGAGCTTTTTTTCATTCTAGTTTAAGTCCAACTATTGAGCTAGGATCATTTTGGCCTCCATGTGGTATTTTCCCCTTTAATCCTTTTCAAGTTCCTTTACTAAATACTGTAATTTTATTGGCTTCTGGGGTAACTGTAACTTGAGCCCATCAATTAATATTAAATAATAATTGAAATGGAGCTAAAAGAGCTTTATTAATAACTTGAATGTTGGGTTTATATTTTTTGATATTACAAGGATTTGAATATTATATAGCATCTTTTAGAATTTCAGATTCTGTATATGGATCAACATTTTTTATAGCTACGGGATTTCATGGATTTCATGTAATTGTTGGTACTTTATTTTTATTTTTTATTTGAACCCGATTAGTTAAAAATCAATTAACGAGAGGACATCATTTTGGGTTTGAAGCTGCTGCTTGATATTGACATTTTGTAGATGTGGTTTGGTTATTTTTGTTTTCTGTAGTTTATTGGTGAGGTACTTAA;

大腹园蛛COIII基因全序列如SEQ ID NO:11所示:

TTGGAAAAGACTTTTCACCCATTTCATATTGTTACTATCTCTCCTTGACCTTTATTAATAGGATTTGGTGTAATATCTGGGGTGATTGGAATAATTAAAATGTTTATATTTATAAAGTTAGATTTATTATTTATATCTTTTTTTATCGCTGTTTTAGTAGCCATTGGTTGGTGACGAGATGTGGTTCGTGAAAGAACTTTTCAAGGTTTTCATTCTAGAAATGTTTTAAGTGGTTTAATATTAGGAATAATCTTGTTCATTGTAAGAGAAATTTTTTTTTTTTTATCTTTTTTTTGGGCCTTTTTTCACTCTAGGTTGAATCCCACAGTTGAGTTAGGTGTAGTATGACCCCCCGAGGGGATTAGTGCTTTTAGTCCGTTTCAAATTCCATTATTAAATACTGTAATTCTTTTGGCTTCGGGAGTTTCTGTTACTTGAGCTCATCAATCTATTTTGAATGAAAATTGAAAATTAGCTGGTCAATCTTTAATAATAACATGAATGCTAGGAATCTATTTTTTGGGTCTTCAAGGGTTTGAATATTATATAGCGGAGTTTAGAATTTCAGATTCAGTATTTGGATCTGTTTTTTTTATGGCTACTGGTTTTCATGGGTTTCATGTAATTGTTGGAAGATTATTTCTTATTGTAATATGATTACGATTGATCAAGGGTCATTTTAGGAGAAGACATCATTTTGGGTTTGAATGTGCAGCTTGATATTGACATTTTGTAGATGTAGTATGATTATTTTTATTCTCGGTAGTATATTGATGGGGAACTTGA;

猫跳蛛COIII基因全序列如SEQ ID NO:12所示:

ATGGAAAAGTTTTTTCATCCTTATCATATAGTTAACATGTCTCCTTGACCTTTAATAGCAGGGTTTGGCGGATTAAGAGTGGTTATTGGAATAATTAATATATTTGTATTTTTTGATTTTACAATGTTATATACTTCTTTATTATTAATATTTGTTATTTCTTTTATGTGATGGCGGGATGTAATTCGGGAAAGAACGTATATAGGATATCATTCTAGAACAGTATTAAGTGGCTTAATATTAGGAATAATTTTATTTATTGTAAGAGAGGTATTTTTTTTTATTTCATTTTTTTGAGCTTTTTTCCATTCTAGATTGAGACCAACACTTGAATTAGGATCAGTATGACCTCCTTGCGGTATTTTGCCTTTTAATCCATTTCAGGTTCCACTTTTGAATACTGTTATCTTATTAGCTTCTGGAGTAACAGTTACATGAGCTCATCAATTTATATTAAATAATAATTGAGAAGGATCGAAGAGGGCTTTAATAATTACATGAATGTTAGGTTTATATTTTTTAATATTACAAGGGTTTGAATATTTTACAGCATCGTTTGGAATTTCTGATTCTGTATATGGATCAACTTTTTTTATAGCGACTGGATTTCATGGCTTTCATGTAATTGTTGGAACTTTATTTTTATTATTTATTTGAATGCGTTTAATTAAAAATCAATTAACAAATAGACATCATTTTGGGTTTGAAGCTGCTGCTTGATATTGACATTTTGTAGATGTAGTATGATTATTTTTATTTTCTGTGGTATATTGATGAGGAACTTAA。

SEQUENCE LISTING

 

<110>  中国计量学院

 

<120>  一种蜘蛛线粒体COIII基因全序列扩增引物及鉴定方法

 

<130>  123456

 

<160>  12   

 

<170>  PatentIn version 3.3

 

<210>  1

<211>  19

<212>  DNA

<213>  人工序列

 

<400>  1

atgttctgaa atttgtggt                                                  19

 

 

<210>  2

<211>  20

<212>  DNA

<213>  人工序列

 

<400>  2

tactacatct acaaaatgtc                                                 20

 

 

<210>  3

<211>  786

<212>  DNA

<213>  拟水狼蛛

 

<400>  3

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<210>  4

<211>  784

<212>  DNA

<213>  三花突蛛

 

<400>  4

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aact                                                                 784

 

 

<210>  5

<211>  786

<212>  DNA

<213>  横纹金蛛

 

<400>  5

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ggtgtgtcag ttacttgagc tcatcaatct attttaaatg aaaattgaaa aatagcaaat    480

 

tattctttaa taataacttg aatattagga atttattttt tatctttaca aggctttgaa    540

 

tattatatag cagaatttag aatttctgat tctgtatttg gttccgtatt ttttatagca    600

 

acagggtttc atggatttca tgtaattgta ggaaggctat ttttattttt tatatgagtt    660

 

cgtttaacaa agagacattt tagaagaagc catcattttg ggtttgaatg tgctgcttga    720

 

tattgacatt ttgttgatgt agtgtgatta tttttatttt cagtagttta ttgatgaggg    780

 

acttaa                                                               786

 

 

<210>  6

<211>  786

<212>  DNA

<213>  锥腹肖蛸

 

<400>  6

ttgtcaaaag tttttcatat ataccatata gtaaatgtct ctccttgacc atttttaatg     60

 

gggtctgctt ctttaagagt agttctagga ctagttaaaa tatttgtttt ttatagattt    120

 

aaatcttttt ttttctctct tttttgtgtg ggtttggtgt ttcttttatg agaaaaggat    180

 

gtggttcgag agagaacttt tcaaggattt cattgtagcc gagtagtaag aggattaatt    240

 

tatgggatga ttttatttat tgttagagaa gtattttttt ttatttcatt tttctgaact    300

 

ttttttcatt ctagtttaaa ccctgtaaca gatttagggg ctgtttgacc ccccataggg    360

 

atttcccctt taaatccttt tagagttcct ttgttaaata ctgtagtttt attagcatct    420

 

ggggtatcaa ttactttatg tcatcaaggt attatcaatg aagattgaaa aaaaagaatt    480

 

ttgtctttag gtataacttg ggggttaggg ttatattttt taatattaca atattttgag    540

 

tataaaatag cagggtttag aatatcggat tctgtttacg gatctgtatt ctttatatca    600

 

acagggtttc atggattcca tgtattagta ggaactttat ttttaatagt aatattcttt    660

 

cgaataatta agtcccattt tagaataaga catcatttag gatttgaatg tgctgcttgg    720

 

tattgacatt ttgtagatgt agtatgatta tttttatttt ctgttgttta ttgatggggg    780

 

tcttaa                                                               786

 

 

<210>  7

<211>  795

<212>  DNA

<213>  华丽肖蛸

 

<400>  7

ttgataaaag tttttcatat atatcatata gttaatatat ccccatgacc gtttttaata     60

 

ggattctctg ccttaagagt ggttttagga ttagtaaaga tattcatttt taaaaatata    120

 

atctctttta tcgccagaat ttgttgtaca atttttattt tctttttatg ggaaaaagat    180

 

gtggttcgag agagaacttt tcaaggaaat cattgtagac gtgttgttga aggtttaatt    240

 

tatggtataa ttttatttat tgttagagaa attttttttt ttctctcttt tttttgagcc    300

 

tttttccact caagtttaaa tcccgtagta gatttaggtt cagattgacc tcctatagga    360

 

atttcccctc taaacccctt tagagttcct ttgttaaata ctgtggtatt attagcttca    420

 

ggggtatcta ttactttttg tcatcagaga attttaaacc aggattgaaa gaaaatagta    480

 

acttcgttaa tagtaacttg ggcacttggt ctatatttct taactttgca atattttgaa    540

 

tataaaatag caggattcag aatttctgat tctgtatttg gatctgtatt ttttatatca    600

 

actggatttc atggtttcca tgtaatggta ggaacgggat ttttattaat tatatttatt    660

 

cgaggaatta agagacattt cagaagaagt catcatttag gatttgaatg tgctgcttgg    720

 

tattgacatt ttgtagatgt agtatggtta tttctatttt cagtagtata ttgatggggt    780

 

tgttaattta agtaa                                                     795

 

 

<210>  8

<211>  786

<212>  DNA

<213>  茶色新圆蛛

 

<400>  8

ttggaaaaaa cttttcatcc ttttcatatt gtaactattt caccatggcc tttattaata     60

 

gggtttggag ttatatctgg tgttattgga ataattaaga tatttatatt tataaagttt    120

 

gatttattat ctatatcatt tttaattgtt gttatagtag cttttgggtg gtgacgagat    180

 

gttgttcggg aaagaacttt tcagggatat cattcaagaa atgtattaag aggattaata    240

 

ctaggaataa ttttattcat tgtaagagaa gtattttttt ttttatcatt tttttgagct    300

 

ttttttcatt caagattaaa tcctactgta gaattaggtg taatttgacc tcctcaggga    360

 

atcaaggcgt ttagtccatt tcaaattcct ttattaaata ctattatttt attagcatct    420

 

ggggtttctg taacatgagc tcatcaatct attttaaatg agaattgaaa gatagcaaat    480

 

tattctttaa tattaacgtg aatattaggc gtttattttt tagggcttca aggtttcgaa    540

 

tattatatag cagaattcag aatttctgat tcagtttttg gatcagtatt ttttatagct    600

 

actggatttc atggatttca tgtaattgtg ggaagattat ttttatttgt aatatgaata    660

 

cgattaacta agagacattt tagaagaagt catcactttg gatttgaaag agctgcttga    720

 

tactgacatt ttgtagatgt agtatggtta tttttatttt ctgtagttta ttgatgagga    780

 

acttaa                                                               786

 

 

<210>  9

<211>  786

<212>  DNA

<213>  脉娲蛛

 

<400>  9

ttggaaaagc attttcatcc ttttcatata gtaaatatat ctccttgacc attagtagta     60

 

ggatttgggg ctttatttat agtagttgga ataattaaaa tgtttatatt ttatgatgta    120

 

agtttattaa tattgtcttt tgtaatatta tttgtggtag ctatattatg gtggcgagat    180

 

gtaattcgag aaagaacctt tcagggattc cactcaagag tggtattgaa gggattgata    240

 

gttggtataa ttttatttat tgtaagagaa attttttttt ttttttcttt tttttgagct    300

 

ttttttcatt ctagacttag tcctacaatt gaattagggt cttattgacc tcctataggt    360

 

attcatcctt ttaatccttt tcaagtgcct ttattaaata ctgtaatttt actttcttca    420

 

ggtgttagag taacttgggc tcatcagctt attttaaggg aagattggta tggggttaag    480

 

atttctttaa tgatgacttg attattggga ttatattttt taatattaca aggatttgaa    540

 

tattatatat cttctactgg aattagagat tctgtttttg gatctacttt ttttatatct    600

 

actggttttc atgggtttca tgttattgtt ggtactttat ttttatttat tatttgaatt    660

 

cgttttttag gtgggcattt ttctggcaga catcattttg gatttgaagc tgcggtttga    720

 

tattgacatt ttgtagatgt agtatgatta tttttatttt ctgttgttta ttggtgaggt    780

 

ggataa                                                               786

 

 

<210>  10

<211>  786

<212>  DNA

<213>  黑色蝇虎

 

<400>  10

ttggaaaagt tttttcatcc ttatcatata gtaaatatgt ctccttgacc tttagttgtt     60

 

ggatttgggg ctataagagt agtaattgga ctagttaaaa tgttctgttt ttttgagact    120

 

gatttattgt ttgtatcttt atatttagta gcaatagtgg ctttattatg atggcgggat    180

 

gtaattcggg agagtacatt tcaaggtctt cattctagaa tagttttaag aggattaata    240

 

gtagggataa tcttatttat tgtaagagag gtattttttt ttatttcttt tttttgagct    300

 

ttttttcatt ctagtttaag tccaactatt gagctaggat cattttggcc tccatgtggt    360

 

attttcccct ttaatccttt tcaagttcct ttactaaata ctgtaatttt attggcttct    420

 

ggggtaactg taacttgagc ccatcaatta atattaaata ataattgaaa tggagctaaa    480

 

agagctttat taataacttg aatgttgggt ttatattttt tgatattaca aggatttgaa    540

 

tattatatag catcttttag aatttcagat tctgtatatg gatcaacatt ttttatagct    600

 

acgggatttc atggatttca tgtaattgtt ggtactttat ttttattttt tatttgaacc    660

 

cgattagtta aaaatcaatt aacgagagga catcattttg ggtttgaagc tgctgcttga    720

 

tattgacatt ttgtagatgt ggtttggtta tttttgtttt ctgtagttta ttggtgaggt    780

 

acttaa                                                               786

 

 

<210>  11

<211>  786

<212>  DNA

<213>  大腹园蛛

 

<400>  11

ttggaaaaga cttttcaccc atttcatatt gttactatct ctccttgacc tttattaata     60

 

ggatttggtg taatatctgg ggtgattgga ataattaaaa tgtttatatt tataaagtta    120

 

gatttattat ttatatcttt ttttatcgct gttttagtag ccattggttg gtgacgagat    180

 

gtggttcgtg aaagaacttt tcaaggtttt cattctagaa atgttttaag tggtttaata    240

 

ttaggaataa tcttgttcat tgtaagagaa attttttttt ttttatcttt tttttgggcc    300

 

ttttttcact ctaggttgaa tcccacagtt gagttaggtg tagtatgacc ccccgagggg    360

 

attagtgctt ttagtccgtt tcaaattcca ttattaaata ctgtaattct tttggcttcg    420

 

ggagtttctg ttacttgagc tcatcaatct attttgaatg aaaattgaaa attagctggt    480

 

caatctttaa taataacatg aatgctagga atctattttt tgggtcttca agggtttgaa    540

 

tattatatag cggagtttag aatttcagat tcagtatttg gatctgtttt ttttatggct    600

 

actggttttc atgggtttca tgtaattgtt ggaagattat ttcttattgt aatatgatta    660

 

cgattgatca agggtcattt taggagaaga catcattttg ggtttgaatg tgcagcttga    720

 

tattgacatt ttgtagatgt agtatgatta tttttattct cggtagtata ttgatgggga    780

 

acttga                                                               786

 

 

<210>  12

<211>  786

<212>  DNA

<213>  猫跳蛛

 

<400>  12

atggaaaagt tttttcatcc ttatcatata gttaacatgt ctccttgacc tttaatagca     60

 

gggtttggcg gattaagagt ggttattgga ataattaata tatttgtatt ttttgatttt    120

 

acaatgttat atacttcttt attattaata tttgttattt cttttatgtg atggcgggat    180

 

gtaattcggg aaagaacgta tataggatat cattctagaa cagtattaag tggcttaata    240

 

ttaggaataa ttttatttat tgtaagagag gtattttttt ttatttcatt tttttgagct    300

 

tttttccatt ctagattgag accaacactt gaattaggat cagtatgacc tccttgcggt    360

 

attttgcctt ttaatccatt tcaggttcca cttttgaata ctgttatctt attagcttct    420

 

ggagtaacag ttacatgagc tcatcaattt atattaaata ataattgaga aggatcgaag    480

 

agggctttaa taattacatg aatgttaggt ttatattttt taatattaca agggtttgaa    540

 

tattttacag catcgtttgg aatttctgat tctgtatatg gatcaacttt ttttatagcg    600

 

actggatttc atggctttca tgtaattgtt ggaactttat ttttattatt tatttgaatg    660

 

cgtttaatta aaaatcaatt aacaaataga catcattttg ggtttgaagc tgctgcttga    720

 

tattgacatt ttgtagatgt agtatgatta tttttatttt ctgtggtata ttgatgagga    780

 

acttaa                                                               786

 

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