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一种拟南芥ZFN3蛋白多克隆抗体及其制备方法

摘要

本发明提供了一种拟南芥ZFN3蛋白多克隆抗体的制备方法,该方法包括以下步骤:(1)构建含有SEQ?ID?No:1和SEQ?ID?No:2所示核苷酸序列的重组表达载体,将所述重组表达载体转化大肠杆菌感受态细胞获得重组蛋白抗原;(2)将所述重组蛋白抗原免疫动物,经血清分离纯化获得拟南芥ZFN3蛋白多克隆抗体。利用本发明所提供的方法制备的多克隆抗体,能够特异性识别拟南芥ZFN3蛋白,而不能识别拟南芥其他蛋白,在ZFN3蛋白的检测和功能鉴定具有广泛用途。ZFN3蛋白抗体的制备为在拟南芥中检测ZFN3蛋白及研究ZFN3蛋白功能具有一定的意义。

著录项

  • 公开/公告号CN105017417A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2015-11-04

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京林业大学;

    申请/专利号CN201510409322.6

  • 申请日2015-07-13

  • 分类号C07K16/16(20060101);G01N33/53(20060101);

  • 代理机构11002 北京路浩知识产权代理有限公司;

  • 代理人王文君

  • 地址 100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学

  • 入库时间 2023-12-18 11:47:40

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-05-29

    授权

    授权

  • 2015-12-02

    实质审查的生效 IPC(主分类):C07K16/16 申请日:20150713

    实质审查的生效

  • 2015-11-04

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种拟南芥ZFN3蛋白多克 隆抗体及其制备方法。

背景技术

拟南芥,是在植物科学,包括遗传学和植物发育研究中的模式 生物之一。拟南芥的优点是植株小、每代时间短、结子多、生活力 强。拟南芥的基因组是目前已知植物基因组中最小的。其整个基因 组已于2000年由国际拟南芥菜基因组合作联盟联合完成,也是第一 个被顺序分析的植物基因组。拟南芥是自花受粉植物,基因高度纯 合,用理化因素处理突变率很高,容易获得各种代谢功能的缺陷型。 由于具有上述这些优点,所以拟南芥是进行遗传学研究的理想材料, 被科学家誉为“植物中的果蝇”。

转录因子是一组识别特异DNA序列的蛋白,能促进或抑制某些 特定基因的转录及表达,从而导致组织细胞结构和功能的改变。转 录因子ZFN3是一种特殊的锌指蛋白(zinc finger protein),它含有 五个CCCH锌指结构,在拟南芥叶片衰老过程中,表达量逐渐升高。 拟南芥yuc6-1D的突变体,能够通过不断积累生长素,来推迟叶片 的衰老,通过基因芯片分析表明,ZFN3基因在该突变体中,表达量 显著下降,ZFN3蛋白编码基因已经被北京大学Leaf Senescence  Database收录为调节叶片衰老的候选基因。但目前关于ZFN3蛋白 的抗体未见报道。

因此有必要提供一种针对拟南芥ZFN3蛋白的多克隆抗体,从 而为研究和利用该蛋白的生物学功能提供有力工具。

发明内容

本发明的目的在于填补现有的拟南芥ZFN3蛋白检测领域的空 白,开发一种针对拟南芥ZFN3蛋白的多克隆抗体及其制备方法。

一种拟南芥ZFN3蛋白多克隆抗体的制备方法,该方法包括以下 步骤:

(1)构建含有SEQ ID No:1和SEQ ID No:2所示核苷酸序列的 重组表达载体,将所述重组表达载体转化大肠杆菌感受态细胞获得重 组蛋白抗原;

(2)将所述重组蛋白抗原免疫动物,经血清分离纯化获得拟南 芥ZFN3蛋白多克隆抗体。

其中,所述SEQ ID No:1和SEQ ID No:2所示核苷酸序列为发 明人通过对拟南芥ZFN3蛋白序列进行大量分析比对发现的两条特异 性多肽片段的编码DNA。

可选的,所述重组表达载体含有如SEQ ID No.3所示的核苷酸序 列。其中,SEQ ID No.3所示的核苷酸序列含有SEQ ID No:1和SEQ ID  No:2所示核苷酸序列,为了使得SEQ ID No:1和SEQ ID No:2所示 的核苷酸序列所编码的多肽片段能够在大肠杆菌感受态细胞中准确 高效的表达获得重组蛋白抗原,发明人在这两段序列之间加入了一段 GGGGGGGGGGGGTCC序列。

可选的,所述重组表达载体是将含有SEQ ID No.1和SEQ ID No.2 所示的核苷酸序列的片段克隆至原核表达载体获得的。

可选的,所述重组蛋白抗原含有如SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所 示的氨基酸序列。

优选的情况下,所述重组蛋白抗原含有如SEQ ID No.6所示的氨 基酸序列。

本发明对于所使用的大肠杆菌感受态细胞的种类没有特别的限 制,只要能够适合重组表达载体在细胞中有效表达即可,优选的情况 下,为了获得更好的表达效果,大肠杆菌感受态细胞为大肠杆菌BL21 (DE3)感受态细胞。

在本发明中,可以利用本领域常规适合于重组蛋白抗原的原核表 达载体,优选的情况下,当所述原核表达载体为pE-SUMOpro时,重 组蛋白抗原的表达效果更好。

在本发明所提供的方法中,免疫动物的步骤包括4次免疫,首先 将纯化的重组蛋白抗原与完全弗氏佐剂混合后第1次免疫动物,而后 将纯化的重组蛋白抗原与非完全弗氏佐剂混合后进行第2-4次免疫, 每次免疫的时间间隔为14天。

在本发明中,免疫动物时所使用的免疫剂量及与佐剂的混合比例 都可以按照本领域常规的方法进行。免疫的动物包括但不限于新西兰 大白兔、小白鼠和大白鼠。

在第四次免疫后第10天,取动物血液,收集抗血清,利用纯化试 剂获得纯度不低于80%的拟南芥ZFN3多克隆抗体。

本分发明还提供了利用本发明所述的方法制备的拟南芥ZFN3蛋 白多克隆抗体。所述多克隆抗体能够特异性的识别ZFN3蛋白中的特 异性氨基酸片段SEQ ID No.4和SEQ ID No.5,为ZFN3蛋白的特异性 抗体。

本发明还提供了所述的拟南芥ZFN3蛋白多克隆抗体的应用。所 述应用包括制备含有所述拟南芥ZFN3蛋白多克隆抗体的试剂或试剂 盒,用于检测拟南芥ZFN3蛋白或进行功能鉴定。

本发明所提供的方法通过PCR方法克隆得到拟南芥ZFN3蛋白 编码DNA中的两段特异性片段的编码DNA,从而获得特异性的多 克隆抗体。利用本发明所提供的方法制备的多克隆抗体,能够特异 性识别拟南芥ZFN3蛋白,而不能识别拟南芥其他蛋白,在ZFN3 蛋白的检测和功能鉴定、研究中具有广泛用途。ZFN3蛋白抗体的制 备为在拟南芥中检测ZFN3蛋白及研究ZFN3蛋白功能具有一定的 意义。

附图说明

图1为目的DNA的PCR扩增结果;

图2为原核表达载体菌体PCR检测电泳图;

图3为重组蛋白SDS-PAGE电泳图;

图4为重组蛋白纯化后SDS-PAGE电泳图,其中,M为蛋白 Marker;1和2为纯化的蛋白;箭头指示的条带为目标蛋白条带;

图5为拟南芥Western检测图片。

具体实施方式

以下将对本发明的具体实施方式进行详细的说明。应当理解的 是,此处所描述的具体实施方式仅用于说明和解释本发明,并不用于 限制本发明。

以下实施例中所使用的仪器和试剂均可以通过购买市售产品的 方式获得。

实施例1

1、拟南芥ZFN3蛋白序列获得

在北京天一辉远生物技术公司通过全基因合成的方法,合成用 于原核表达载体构建的DNA序列,即合成SEQ ID No.3所示的核苷 酸序列,将SEQ ID No.3所示的核苷酸序列克隆至载体pGM-T(购 自北京天根生物公司)中,经DNA测序序列正确,将其命名为 pGM-ZP质粒。

2、原核表达载体构建:设计一对引物用于构建原核表达载体引 物:

ZP-f:5’-GAACAGATTGGAGGTAACTTGATGGTTTCTGTTCG-3’

ZP-r:5’-GTGAGACCGGTACCATCAGAATTCGAGTGATGTGGG-3’

以pGM-ZP质粒为模板,进行PCR扩增。PCR程序为:95℃变 性30s,60℃退火30s,72℃延伸30s,25个循环。PCR产物经凝胶 电泳分析,获得约为250bp的DNA条带(图1),产物回收纯化待 用。

提取原核表达载体pE-SUMOPro质粒,SpeI酶切pE-SUMOPro, 回收、纯化酶切产物。按照pE-SUMOPro载体:PCR产物片段为1: 1的比例,用无缝连接酶于50℃连接15min,将连接产物转化大肠 杆菌感受态BL21(DE3),经氨苄青霉素筛选后,挑取单克隆菌落 进行菌体PCR检测(图2),选取PCR检测阳性菌落,命名为 SUMO-ZP。

3、重组蛋白表达及纯化:

将含有SUMO-ZP的大肠杆菌菌液,接种至LB培养液中,使用 恒温摇床,37℃,180rpm培养,待菌体OD值达到0.6,加入终浓 度1mM的IPTG,并将温度调至30℃,180rpm继续培养6h。取50ml 大肠杆菌菌液,放置在离心机,10000rpm,1min,弃上清收集菌体, 加入10ml PBS,重新悬浮菌体。将重新悬浮的菌体放置在冰浴中, 使用超声破碎仪,进行菌体破碎。将破碎处理后的菌液,放置在离 心机中,12000rpm,10min,分别收集上清和沉淀,沉淀使用10ml PBS 重新悬浮,分别取两种溶液10μl,加入10μl 2×SDS缓冲液,沸水煮 沸10min,离心后,取上清进行SDS-PAGE检测,检测结果显示: 上清中含有一条目的蛋白大小的条带(图3)。将上清溶液,经Ni 柱纯化后,进行SDS-PAGE检测,结果显示:能够纯化出目标蛋白 条带,与预测目的蛋白大小一致(图4),其氨基酸序列为SEQ ID No: 6所示。

4、免疫动物:

将纯化的重组蛋白与完全弗氏佐剂1:1混合,进行第一次免疫, 第一次免疫后第14天,将纯化的抗原与非完全弗氏佐剂1:1混合, 进行第二次免疫,第二次免疫后第14天,将纯化的抗原与非完全弗 氏佐剂1:1混合,进行第三次免疫,第三次免疫后第14天,将纯化 的抗原与非完全弗氏佐剂1:1混合,进行第四次免疫进行;

5、抗体分离及纯化:

待第四次免疫后第10天,将免疫用青年新西兰大白兔(体重: 6-7斤,购自芳缘养殖场),采用颈动脉放血,将血液在37℃恒温箱 中放置30分钟,再在4℃放置过夜。用药铲将血凝块从管壁上拨落, 将血液转移至塑料离心管中,4℃,10000g离心10min,收集上清液 即为抗血清。使用康为世纪公司的Protein A+G Agarose试剂(货号: CW0349)纯化抗体,具体步骤:

(1)在10ml抗体血清中加入100μl充分重悬的Protein A+G  Agarose,4℃缓慢摇动3个小时;

(2)2500rpm离心5分钟,小心吸除上清;

(3)用PBS洗涤沉淀5次,PBS的用量每次为10ml。洗涤时 离心条件:2500rpm离心5分钟,小心吸除上清。

(4)完成最后一次洗涤后,去除上清,检测产物纯度,产物抗 体的纯度为86%。

6、抗体检测:

选取野生型拟南芥和ZFN3基因突变拟南芥为实验材料,使用 康为世纪公司的植物蛋白质提取试剂盒(货号:CW0885B),分别 提取总蛋白。具体步骤为:选取拟南芥叶片组织大约100mg,放置 在研钵中,加入抽提试剂0.5ml,进行匀浆处理;匀浆后冰上孵育 20分钟后,利用低温高速冷冻离心机4℃12,000rpm,离心20分钟; 收集上清中的可溶性蛋白,放置在4℃,待下一步实验。

提取蛋白质,经SDS-PAGE电泳后,经半干转膜仪,转移至硝 酸纤维素膜上,以5%的脱脂奶粉(TBST缓冲液溶解)在4℃条件 下,封闭2h;加入纯化的多克隆抗体(1:5000),在4℃条件下,反 应12h;加入辣根过氧化物标记的羊抗兔IgG抗体(1:2000),在37℃ 条件下,反应1h;采用化学发光显色,检测结果如图5所示,野生 型拟南芥有一条单一清晰的杂交条带,而突变体中没有检测信号(图 5)。

结果证明:本发明所制备的多克隆抗体,能够识别植物体内的 ZFN3蛋白,而且能够特异性地与拟南芥ZFN3蛋白结合。

结论:上述实验结果表明,制备的拟南芥ZFN3蛋白多克隆抗 体能够识别拟南芥中的ZFN3蛋白,能够检测ZFN3蛋白,而不与 植物体内的其他蛋白发生作用。该多克隆抗体,可以作为ZFN3蛋 白检测试剂,对ZFN3蛋白的功能鉴定具有重要的意义。

虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了 详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这 对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神 的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。

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