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一种二代序列和三代单分子实时测序序列联合组装方法和系统

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摘要

本发明公开了一种二代序列和三代单分子实时测序序列联合组装方法和系统，该方法包括：二代序列组装获得一级二代基因组骨架序列；二代序列对一级二代基因组骨架序列进行补洞，获得二级二代基因组骨架序列；三代单分子实时测序序列对二代基因组骨架序列进行补洞，获得一级二三代骨架序列；自纠错后的三代单分子实时测序序列利用与一级二三代骨架序列相互重叠关系进行拼接，获得二级二三代骨架序列；二代序列与二级二三代骨架序列进行比对获得无效比对区域，并用无效序列对该区域进行替换，获得三级二三代骨架序列；用二代序列对三级二三代骨架序列进行补洞，获得最终基因组组装序列。本发明的方法能够提高基因组组装的指标和准确性。

著录项

  • 公开/公告号CN107784198A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-03-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳华大基因科技服务有限公司;

    申请/专利号CN201610741984.8

  • 发明设计人 邓天全;贺丽娟;杨林峰;刘亚斌;

    申请日2016-08-26

  • 分类号G06F19/18(20110101);

  • 代理机构44281 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司;

  • 代理人孙银行;彭家恩

  • 地址 518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼科技创业园201

  • 入库时间 2023-06-19 04:42:50

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-04-03

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20160826

    实质审查的生效

  • 2018-03-09

    公开

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