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基于微生物丰度的MIBC分型及预后预测模型构建方法

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本发明公开了一种肌层浸润性膀胱癌（MIBC）分型方法，该方法依据MIBC患者的组织微生物丰度谱特征对MIBC进行分子分型。本发明还公开了基于上述分型方法的MIBC预后预测模型及其构建方法。本发明利用TCGA数据库中的肌层浸润性膀胱癌转录组RNA‑seq数据，分析得到MIBC患者的微生物数据，然后以微生物丰度谱为特征进行NMF聚类，建立MIBC微生物层面的分子分型，从而从肿瘤组织微生物层面深度解析了微生物与MIBC的相关性，建立了MIBC预后预测模型，该模型有助于精准预测MIBC患者的1‑5年生存率。

著录项

公开/公告号CN114203256A

专利类型发明专利
公开/公告日2022-03-18

原文格式PDF
申请/专利权人上海仁东医学检验所有限公司;苏州仁东生物工程有限公司;
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申请/专利号CN202210148697.1
发明设计人金鸽;薛银鸽;林为丽;徐小红;赵婷婷;
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申请日2022-02-18
分类号G16B15/30(20190101);G16B20/00(20190101);G16B30/00(20190101);G16B40/00(20190101);
代理机构31325 上海市汇业律师事务所;
代理人陆红杰
地址 201318 上海市浦东新区半夏路100弄11号1-3层、地下1层
入库时间 2023-06-19 14:32:54

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2022-03-18

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