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基于粒子群算法的改进最小残差法分析混合STR图谱

摘要

一种基于粒子群算法的改进最小残差法分析混合STR图谱的方法:S100:输入来自两个供体的混合STR图谱;S200:在(0,0.5]区间内随机生成3个粒子的初始位置,并在[‑0.01,0.01]区间内随机生成所述3个粒子的3个初始速度;S300:分别根据所述3个粒子计算得出3个residualsum;S400:分别计算3个粒子各自的个体最优位置,获得residualsum最小时Mx的值;S500:计算整个粒子群体的全局最优位置,获得residualsum最小时Mx的值;S600:更新所述3个粒子的速度和位置;S700:如果迭代次数达到阈值,则获得residualsum最小值、混合比例预测值Mx’和拆分结果;否则返回到步骤S300继续执行。本方法改进了最小残差法,重新定义混合比例实现等位基因模型(allele model)的化简;粒子群算法的引入,能够实现混合STR图谱的快速分析。

著录项

  • 公开/公告号CN115035957A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-09-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 陕西师范大学;

    申请/专利号CN202210613817.0

  • 发明设计人 李鑫;范虹;赵兴春;范栋;姚若侠;

    申请日2022-05-31

  • 分类号G16B40/00;G06N3/00;G06T7/00;G06T7/62;

  • 代理机构北京前审知识产权代理有限公司;

  • 代理人张静;张波涛

  • 地址 710000 陕西省西安市雁塔区长延堡办长安南路东侧

  • 入库时间 2023-06-19 16:44:31

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-09-09

    公开

    发明专利申请公布

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