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一种基于JSON的基因本体映射系统及方法

摘要

本发明公开了一种基于JSON的基因本体映射系统及方法,包括基因本体的自动识别与数据抽取,从基因本体到JSON的映射机制及基于JSON的基因本体数据存储。具体步骤为:识别基因本体中的元数据信息,获取基因本体元数据中的细胞组分(cellular component)、分子功能(molecular function)、生物过程(biological process)三个类别以及父子关系(is_a)、部分关系(part_of)和调控关系(regulates)三种关系特征;建立基因本体元数据特征与JSON模型的一一对应映射规则,采用半监督学习方法完成元数据抽取;构建基于JSON的基因本体存储模型,完成从基因本体到JSON的数据迁移。本发明建立了基因本体与JSON的映射模型,解决了基因本体数据无法自动转换成JSON数据的难题,实现了基因本体在异构Web平台间的高效数据交互与充分共享。

著录项

  • 公开/公告号CN112187953B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-05-03

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南开大学;

    申请/专利号CN202011090831.4

  • 发明设计人 刘健;陈娇;陈萍;

    申请日2020-10-13

  • 分类号H04L67/02;H04L67/06;H04L67/565;H04L67/563;G06F16/21;

  • 代理机构北京科家知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人徐思波

  • 地址 300110 天津市南开区卫津路94号

  • 入库时间 2022-08-23 13:35:03

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