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SELECTION METHOD OF EXPERIMENT SEGMENT FOR EXPRESSION VARIATION GENE EXTRACTION OR PATHWAY ANALYSIS, USING TRANSCRIPTOME

机译:表达谱提取或路径分析的实验段选择方法

摘要

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for determining if a subject should be subjected to DEG extraction or pathway analysis by objective criteria using transcriptome data obtained from any experiment segment.SOLUTION: Using a value of Hor Scalculated on the basis of each gene expression level Pobtained from transcriptome data and the formula (I) or (II), an experiment segment is selected. (I): S=(P-a), except for Pa, where a is a constant satisfying 0.00001a0.1; (II): H=-(P.logP), except for P=0.
机译:解决的问题:提供一种方法,使用从任何实验部分获得的转录组数据,通过客观标准确定受试者是否应进行DEG提取或途径分析。解决方案:使用基于每个基因表达计算的Hor S值从转录组数据和式(I)或式(II)获得的水平,选择实验片段。 (I):S =(P-a),P <a除外,其中a为满足0.00001 <a <0.1的常数。 (II):H =-(P.logP),除了P = 0。

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