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基于Vegan软件包的生态学数据排序分析

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群落学数据一般是多维数据,例如物种属性或环境因子的属性.多元统计分析是群落生态学常用的分析方法,排序(ordination)是多元统计最常用的方法之一.CANOCO是广泛使用的排序软件,但缺点是商业软件价格不菲,版本更新速度也很慢.近年来,R语言以其灵活、开放、易于掌握、免费等诸多优点,在生态学和生物多样性研究领域迅速赢得广大研究人员的青睐.R语言中的外在软件包"Vegan"是专门用于群落生态学分析的工具.Vegan能够提供所有基本的排序方法,同时具有生成精美排序图的功能,版本更新很快.认为Vegan包完全可以取代CANOCO,成为今后排序分析的首选统计工具.本文首先简介Vegan的基本信息和下载安装过程,然后以古田山24hm2样地内随机抽取40个20m×20m的样方为例,展示vegan包内各种常用排序方法(PCA,RDA,CA和CCA)和排序图生成过程,希望能为R的初学者尽快熟悉并利用Vegan包进行排序分析提供参考.

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来源
《第九届全国生物多样性保护与持续利用研讨会》|2010年|332-343|共12页
会议地点厦门
作者
LAI Jiangshan; 赖江山; MI Xiangcheng; 米湘成;
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作者单位

国际生物多样性计划中国委员会;

中国科学院生命科学与生物技术局;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类植物生态学;
关键词
植物群落; 生态学; 数据排序; 影像编辑软件包;

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