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燕麦属细胞质基因组PCR-RFLP分析

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燕麦属(Avena L.)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae)在全世界约29个种,含有6种染色体组组成类型(A、C、AB、AC、CC和AACCDD).燕麦属不同倍性以及不同基因组构成的物种是栽培燕麦产量、品质和抗性改良的重要基因库.但是,相似的形态和重叠的地理分布使燕麦属部分物种的分类与鉴定存在困难;染色体组构成和倍性差异更增加了分类鉴定的复杂性,这种情况阻碍了对这些燕麦物种优异遗传资源的有效利用.此外,由于缺乏明确的二倍体供体物种,燕麦属异源多倍体的起源一直存在争议.本文采用PCR-RFLP技术对燕麦属25个种的35个居群以及1个外类群共36份材料细胞质基因组DNA片段进行遗传变异分析.这14个细胞质引物中,除trnD-T,atpA-atp9,rps14-cob,trnS-trnfM这4个引物不能得到理想的扩增产物外,其余标记均能得到一条清晰产物,且扩增产物直接电泳均无多态性.利用BsuRI,HpaII,Hin6I,HinfI,TaqI,HindIIIi,BamHI这7种限制性内切酶对10个标记的扩增产物酶切消化后,在70种标记/酶组合中,共有3个标记(占30％)的5种标记*酶组合(7.14％)能检测到多态性.在所有70种标记/酶组合中,共检测到144条酶切片段,其中13条(占12.4％)具有多态性.细胞质STS标记揭示了燕麦种间的遗传相似系数(GS),所有材料的GS变化范围为0.7059～1,平均值为0.9227.利用细胞质STS标记的遗传距离系数,采用UPGMA法构建了36份燕麦种间的遗传关系聚类图.结果表明:利用10个细胞质STS标记的70种标记/酶组合可以对燕麦的一些种进行区分,并可在燕麦染色体组起源问题上提供相关信息.

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