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牡丹查耳酮合酶基因Ps-CHS1的克隆及其组织特异性表达分析

摘要

以牡丹品种‘彩绘’(Paeonia suffruticosa‘Cai Hui’)为试材,采用RT-PCR和RACE方法从花瓣中获得了一个牡丹查耳酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因cDNA全长序列,命名为Ps-CHS1,GenBank登录号为GQ483511.序列分析结果表明,Ps-CHS1全长1475 bp,包含82 bp的5‘非编码区、208 bp的3’非编码区和一个长度为1 185 bp编码394个氨基酸的开放阅读框.氨基酸序列分析显示该基因编码的蛋白具有CHS家族保守存在的所有功能活性位点和特征多肽序列.序列比对和系统进化分析表明,Ps-CHS1与杨柳科、锦葵科、蔷薇科等植物的CHS亲缘关系较近,相似性达90%以上.荧光定量PCR分析表明,Ps-CHS1在花瓣中的表达量最高,其次是萼片,再次是叶片和雄蕊,在心皮中表达量最低.

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