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真曲巴菲蛤(Paphia euglypta)线粒体基因组全序列测定及比较基因组学研究

摘要

动物线粒体基因组是研究基因组进化模式与机制的良好模型。已知无脊椎动物尤其是贝类的线粒体基因组表现出高度变异性,而双壳类是目前已知变异程度最高的类群。真曲巴菲蛤(Paphia euglypta)隶属于帘蛤科(Veneridae),主要分布于我国浙江以南沿海地区,栖息于潮下带细沙泥质海底,是我国重要的经济贝类。GenBank目前已经公布帘蛤科2种类菲律宾蛤仔(Venerupis philippinarum)和文蛤(Meretrixpetechialis)的线粒体全序列。经比较分析发现,这两种的线粒体基因组表现出很大的差异,如tRNA数量、基因排列顺序等。基于这些发现,本研究通过测定帘蛤科中第三个物种的线粒体基因组全序列,分析帘蛤科种类线粒体基因组的进化模式及机制。结果表明:真曲巴菲蛤线粒体全长18643 bp,包含12个蛋白编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因,且所有基因均由一条链编码:与许多海洋双壳贝类相同,它缺少atp8基因。

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