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多位点分型技术应用于浙江省脑膜炎奈瑟菌基因分型研究

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目的：对浙江省2004～2013年分离的54株脑膜炎奈瑟菌(Neisseriameningitidis,Nm)进行基因分型研究,了解菌株间的遗传进化关系.rn 方法：参照细菌分子分型和基因组差异公共数据库(Pubmlst)提供的引物与方法,获得多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)序列型(Sequence Type,ST).采用进化分析软件(Splitstree)4、聚类分析软件(eBURST)V3等处理所得序列数据,并构建遗传进化图谱.rn 结果：54株Nm得到21个STs,其中11个STs为新发现,主要序列型ST-7和ST-4821分别占29.63％和27.78％.不同血清群其STs/ST-克隆群(Complex)有明显不同,A群菌株78.95％(15/19)为ST-7/ST-5Complex(15/19);B群菌株STs分散,57.14％(8/14)呈单体存在;C群菌株82.35％(14/17)为ST-4821/ST-4821Complex.不同来源分离株其ST-Complex不同,来自病人及密切接触者分离株ST-5Complex分别占48.15％(13/27)及33.33％(4/12)、ST-4821Complex分别占40.74％(11/27)及25.00％(3/12),而来自健康带菌者分离株ST-4821Complex克隆群占40.00％(6/15).7个管家基因的核苷酸多态性(Pi)范围为0.01298(adk)～0.11100(aroE).Splitstree4构建径向系统进化树显示,浙江省Nm菌株分属5个分枝,主要序列型ST-7及ST-4821分别分布于3分枝及2分枝中,4分枝中均为浙江省STs.eBURST V3聚类分析发现,浙江省STs/ST-5Complex基因型相对稳定,但浙江省STs/ST-4821Complex基因型已具遗传多样性变化.rn 结论：浙江省Nm以A群78.95％(15/19)ST-7/ST-5Complex和C群82.35％(14/17)ST-4821/ST-4821Complex两大克隆群占绝对优势,B群57.14％(8/14)呈单体分散.浙江省A、B、C群均存在ST-4821Complex相同基因型菌株,可能不同血清群之间已产生荚膜转换,其种群间已显示基因重组进化特征,这是中国首次从A群Nm中检出ST-4821/ST-4821Complex及ST-5798/ST-4821Complex菌株.

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来源
《第六届传染病防控技术研究与应用技术论坛》|2015年|1-15|共15页
会议地点吉林延边
作者
ZHU Shui-rong; 朱水荣;
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作者单位

中华医学会;

中国微生物学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 R378.15;
关键词
脑膜炎奈瑟菌; 基因分型; 遗传进化规律; 多位点序列分型;

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