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菜青虫野田村病毒亚基因组RNA3的鉴定及非结构蛋白B2抑制RNAi功能分析

摘要

2006年,我们研究组在武汉市武昌县的甘蓝菜地里,从菜青虫颗粒体病毒感染死亡的菜青虫体内分离到一株野田村病毒,命名为武汉野田村病毒(Wuhan Nodavirus,WhNV)(Virus Res. 2006,120: 28-35; Virus Res. 2006,121: 17-22 )。WhNV基因组由两条正义单链分子RNA1和RNA2组成,全基因组测序表面,RNA1由3149个核营酸组成,而RNA2则由1562个核昔酸组成。WhNV的基因组结构分析显示,RNA1上一共有三个潜在的开放阅读框(open reading frame, ORF),分别编码ProA (nt 34-3076 ) , B1(nt2620-3076)和B2 (nt2795-3050),其中ProA由RNA1编码,而B1和B2则由复制过程中产生的亚基因组RNA3编码。在三个ORF中ProA与B1同框,而B2位于ProA开放阅读框的+1位。RNA2上只有一个编码壳蛋白前体Proα的ORF。

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