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柔性生物分子结合识别的自组装理论与模拟

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目前来看，从全局和物理角度对分子识别过程的理解还是很有挑战性的。通过计算态密度的方法，量化了柔性分子识别过程中的内禀的能量地貌。通过研究15个同型二聚体的有效的量化的能量地貌(一个为结合，另外两个为折叠)，成功地把这15个二聚体分成了“折叠-结合耦合”的两态结合二聚体和“折叠先于结合”的三态结合二聚体，这些结论和之前的模拟及实验结果完全一致。更进一步，发现，结合过程中有效的折叠和结合的能量地貌之间的关系决定着二聚体的结合机制的方式。同时，通过量化柔性结合过程的全局能量地貌，发现描述全局能量地貌拓扑结构的物理量和结合过程的热力学及动力学都有着非常强的关联，即紧密地联系着生物分子实现其功能的可行性和效率快慢。

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来源
《国家自然科学基金委员会“可控自组装体系及其功能化”重大研究计划年度交流暨研讨会》|2014年|218-219|共2页
会议地点南京
作者
汪劲;
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作者单位

国家自然科学基金委员会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类生物化学技术;
关键词
柔性生物; 分子识别; 构象变化; 自组装理论;

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