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基于RAPD标记的中国板栗(Castanea mollissima)遗传连锁图构建

摘要

本文对基于RAPD标记的中国板栗遗传连锁图进行了构建。文章在所使用的20组共400条RAPD随机引物中187条引物在所试的"薄皮"和"垂枝,,两个亲本无性系及其5个杂交后代之间获得了清晰、重复性好的多态性条带,占供试引物的46.75﹪.筛选出的多态性引物在两亲本及其60个杂交后代中的多态性条带的分离比通过卡方测验(显著性标准为0.05)是否符合预期,结果共有143个标记符合1:1测交分离比,这些标记用于构建中国板栗遗传连锁图谱,其中母本88个,父本55个,标记分组和编号应用Mapmaker软件分析,设定LOD值为3和最大重组值θ为0.50作为可信统计度与最大连锁标记数量之间的最佳组合,其中母本的标记定位了10个连锁组,父本的标记定位了7个连锁组.母本框架图谱总长823.1cM(Kosambi),覆盖了基因组的66.7﹪;父本框架图谱总长720.8cM(Kosambi),覆盖了基因组的41.7﹪.母本标记间的大小从1.6cM到26.5cM,平均9.4cM,连锁组的大小从15.5cM到166.3cM,平均为82.3cM父本标记间的大小从2.1cM到39.9cM,平均13.1cM,连锁组的大小从53.5cM到139.6cM,平均为103.0cM

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