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H5亚型禽流感病毒分离株HA基因序列分析和同源性比较

摘要

本研究在2001-2002年间从山东、河北发病鸡群中分离到的6株H5亚型禽流感病毒(AIV).首先设计合成了一对HA基因特异性引物,利用一步法RT-PCR,对这些毒株的HA基因进行了扩增测序,并和国内已经发表的H5亚型毒株HA基因进行了序列的分析和比较.结果表明HA基因全长约1.7kb,各分离株与3个参考毒株HA基因的同源性为96.4﹪-99.2﹪,各分离株之间HA基因的同源性为96.4﹪-99.6﹪.此外,根据HA基因序列进行HA裂解位点氨基酸推导,发现各分离株的裂解位点均包含多个碱性氨基酸,符合高致病性AIV的特征.

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