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新城疫病毒不同毒株F基因的克隆与遗传变异分析

摘要

对包括标准攻毒用强毒F<,48>E<,8>株和疫苗毒La Sota株及12株分离株在内的共14株NDV的F基因进行RT-PCR扩增和序列测定,并进行遗传变异分析.核苷酸序列同源性分析显示,La Sota株同其他13株强毒株的同源性在85.0﹪~89.8﹪之间,同源性普遍较低;国内分离株之间的同源性在88.2﹪~99.4﹪之间,表明近几年来流行的NDV毒株之间在基因水平存在一定差异.F蛋白裂解位点氨基酸组成分析表明,F<,48>E<,8>株及12个分离株F蛋白裂解位点均符合强毒株裂解位点特征.系统发育进化树的绘制结果显示,9株分离株为基因Ⅶ型,2株分离株为基因Ⅵ型,1株分离株为基因Ⅷ型,另外可以看出,ZD-1/02、ZD-2/02、ZD-3/02、BJ/98、YQ/01、TJ/99株同鹅源的NDV株JS01-5-GO、ZJ00-1-GO及JS98-3-GO株的距离较近,说明当今鸡ND的流行同鹅的ND有着密切的关系.

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