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转录组分析地黄环烯醚萜苷生物合成相关基因

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目的：获得地黄转录组信息,探索地黄环烯醚萜苷生物合成途径相关基因. 方法：采用Illumina HiSeq2500技术对地黄脱毒苗进行转录组测序,利用Trinity软件组装得到的转录本构建地黄的Unigene库,并基于此进行基因功能注释、SSR查找等一系列生物信息学分析. 结果：De novo组装后共获得70,778条Unigene.地黄转录组中共有81个Unigene参与萜类骨架合成;共有226个Unigene可能参与CYP450介导的环烯醚萜骨架的氧化修饰;共有102个Unigene与糖基转移酶相关. 结论：地黄转录组数据库的获得为探索地黄环烯醚萜类成分的生物合成研究奠定了基础,为后续基因功能的分析等研究提供分子水平依据.

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来源
《河南省遗传学会2015年学术年会》|2015年|102-114|共13页
会议地点河南周口
作者
ZHU Yun-hao; 朱昀昊; ZHAO Le; 赵乐; DONG Cheng-ming; 董诚明; Zheng Qiao-ke; 郑晓珂; FENG Wei-sheng; 冯卫生;
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作者单位

河南省遗传学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类多年生;
关键词
地黄; 环烯醚萜苷类化合物; 生物合成; 功能基因; 转录组测序;

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