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灵芝精氨酸甲基转移酶基因鉴定及表达分析

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目的：本研究在灵芝转录组基础上,对灵芝精氨酸甲基转移酶GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析. 方法：利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、二级结构、三级结构和系统发育进化等进行分析和预测;利用转录组FPKM值分析灵芝不同生长时期GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因的相对表达量. 结果：生物信息学分析表明GLPRMT1和GLPRMT2均具有完整的ORF区且为全长,而GLPRMT3不为全长cDNA;蛋白结构域分析显GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3都具有组蛋白精氨酸甲基转移酶最保守的AdoMet-MTases结构域;利用同源建模法对灵芝的PRMT进行分析,预测了其整体空间结构;系统进化树聚类分析显示GLPRMT1、GLPRMT2、GLPRMT3分别与真菌的PRMT3家族、PRMT1家族和PRMT5家族聚为一支;基因表达水平显示GLPRMT2的表达量明显高于GLPRMT1、GLPRMT3,且3个精氨酸甲基转移酶基因表达随着灵芝个体的发育均呈上升趋势. 结论：本研究结果为揭示灵芝表观调控机理奠定了理论基础.

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来源
《世界中医药学会联合会道地药材多维评价专业委员会成立大会暨第一届学术年会》|2015年|1-8|共8页
会议地点成都
作者
ZHA Liang-ping; 查良平; LIU Shuang; 刘爽; YUAN Yuan; 袁媛; HUANG Lu-qi; 黄璐琦;
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作者单位

世界中医药学会联合会道地药材多维评价专业委员会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类植物药;化学分析与鉴定;
关键词
灵芝; 精氨酸甲基化转移酶; 组蛋白甲基化; 生物信息学; 基因鉴定;

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