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胃癌相关长链非编码RNA lncRNA-MTM的生物学功能及其机制研究

摘要

目的:研究长链非编码RNAlncRNA-MTM在胃癌发生发展中的作用及其分子机制. 方法:1.运用基因表达芯片技术,同时检测6对胃癌及配对癌旁非肿瘤组织样本中lncRNA和mRNA的表达谱,筛选胃癌中差异表达的lncRNA.2.通过实时荧光定量PCR的方法,在50对胃癌及配对癌旁非肿瘤组织样本中验证lncRNA-MTM的表达情况,并分析lncRNA-MTM的表达水平与临床病理特征的相关性.3.通过实时荧光定量PCR的方法,在7个人胃癌细胞系(AGS、BGC823、HGC27、MGC803、SGC7901、MKN28和MKN45)和一个人胃粘膜细胞系(GES-1)中检测lncRNA-MTM的表达.通过干预(过表达及小干扰RNA干扰)胃癌细胞中lncRNA-MTM的表达,并结合体外细胞功能学试验(transwell细胞迁移和侵袭试验、流式细胞周期和凋亡检测、CCK-8细胞增殖试验、平板细胞克隆形成试验)研究lncRNA-MTM在胃癌细胞增殖、凋亡、细胞迁移及侵袭等生物学过程中的作用.4.运用生物信息学分析,预测lncRNA-MTM可能相互作用的靶蛋白,并用实时荧光定量PCR方法进行验证. 结果:1.芯片结果显示,与配对癌旁非肿瘤组织相比,胃癌组织中上调的lncRNA有501个,下调的lncRNA有191个,lncRNA-MTM是其中表达下调的一个长链非编码RNAo2.在50对组织中验证发现,与配对癌旁非肿瘤组织相比,胃癌组织中lncRNA-MTM的表达显著下调(p<0.001),平均下调倍数为2.69倍。1ncRNA的表达水平与肿瘤分期(p<0.05)、肿瘤侵润深度(p<0.05)及淋巴结转移情况(p<0.05)相关,而与患者的年龄、性别、肿瘤大小、分化程度等无关(p>0.05)。3.与GES-1相比,lncRNA-MTM在胃癌细胞BGC823,SGC7901中表达上调,而在AGS,HGC27,MGC803,MKN28和MKN45中表达下调。在相对低表达的胃癌细胞HGC27,MGC803中,过表达lncRNA-MTM显著抑制胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭,促进细胞的凋亡(p<0.05)。而在相对高表达的胃癌细胞BGC823,SGC7901中敲低lncRNA-MTM的表达,则表现出相反的生物学行为改变。4.根据芯片结果,结合生物信息学分析,发现lncRNA-MTM与148个mRNA存在正相关,与114个mRNA存在负相关。通过q-PCR验证发现,lncRNA-MTM可能与金属硫蛋白基因家族蛋白(MTs)和金属基质蛋白酶家族蛋白(MMPs)存在相互作用,并通过MTs和MMPs发挥生物学作用。 结论:长链非编码RNA lncRNA-MTM抑制胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并可能通过与MTs和MMPs等蛋白相互作用而发挥生物学作用。

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