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高粱花叶病毒广西甘蔗分离物全基因组序列分析

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近年来,高粱花叶病毒(sorghum mosaic virus,SrMV)已成为危害广西甘蔗的主要病原病毒,但尚未见侵染本地区甘蔗的SrMV全基因组序列的报道.本研究以田间一株感染SrMV的甘蔗为材料,提取叶片总RNA,通过RT-PCR及RACE技术扩增获得9626nt(不包括polyA尾)的病毒全长基因组序列,命名为SrMV-GX.序列分析表明,SrMV-GX与浙江萧山分离物(SrMV-XoS)、浙江余杭分离物(SrMV-YH)和美国德克萨斯州分离物(SrMV-H)的核苷酸同源性分别为95.4％、94.7％和80.9％;编码的多聚蛋白氨基酸同源性分别为97.8％、98.4％和90.4％.与马铃薯Y病毒科的其它成员一样,SrMV-GX基因组中存在一个小的ORF(pretty interesting potyviridae ORF,pipo),且其序列非常保守.本研究对SrMV-GX进行序列分析,为进一步研究SrMV的遗传多样性,改进现有的检测方法及培育健康脱毒甘蔗种苗提供理论依据.

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来源
《广西甘蔗学会第十届代表大会暨2015年学术交流会》||1954-960|共8页
会议地点广西来宾
作者
Zhou Longwu; 周龙武; 徐正银; Xu Zhengyin; Tang Yao; 唐瑶; Lv Bangli; 吕榜丽; Li Jianyong; 李建勇; Si Huijuan; 司慧娟; 温荣辉; Wen Ronghui; Chen Baoshan; 陈保善;
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作者单位

广西甘蔗学会;

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关键词
甘蔗; 抗病育种; 高粱花叶病毒; 全基因组序列;

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