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基于28S rRNA在泰勒虫上的进化分析

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本研究对国内感染牛和绵羊的13株泰勒虫的大亚基核糖体RNA序列(28S rRNA)进行了扩增、测序,序列长度在3,031bp-3,061bp之间.由于考虑到扩增28S rRNA基因的全长序列有难度,而且其内部的保守区在进化分析时不太重要,所以又选择其第二、第三变异区(D2-D3)与全长序列在系统进化分析方面进行比较.另外对变异区序列的二级结果进行预测,来评估其作为分子标记基因的可行性.结果:(i)28S rRNA在泰勒虫上作为一个新的分子标记基因,可用于其分子分类及系统进化分析.例如,瑟氏/水牛/东方泰勒虫和中华泰勒虫都感染牛,具有低致病性,显示出具有较近的亲缘关系.另外两种绵羊泰勒虫:吕氏泰勒虫和绵羊泰勒虫也被分在同一分枝中.(ii)D2-D3区作为一段短的分子片段,区分各种泰勒虫的能力与其全长一致,是一段很有潜力的条形码候选基因.(iii)尽管该区域在一级结构上显示出很强的可变性,但在二级结构上,除环形泰勒虫宁夏株外,其余虫株都显示出种内保守,种间变异的特征.这说明预测序列的二级结构,作为一种新方法也可以被利用到泰勒虫的分子分类和进化分析中.总之,本研究应用28SrRNA作为分子标记来研究在中国境内分离的泰勒虫间的进化关系.D2-D3区由于具有很高的变异性很适合作为理想的分类分子片段.而有关二级结构信息,为研究泰勒虫的一些争议种及未定种提供了新的思路.

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来源
《中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第七次代表大会暨第十二次学术研讨会》|2013年|186|共1页
会议地点郑州
作者
苟惠天; 关贵全; 刘爱红; 刘志杰; 李有全; 任巧云; 陈泽; 杨吉飞; 殷宏; 罗建勋;
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作者单位

中国畜牧兽医学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类兽医原虫学;
关键词
兽医学; 泰勒虫; 分子标记; 系统进化;

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