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基于28S rRNA在巴贝斯虫上的进化分析

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本研究使用大亚基核糖体RNA(28S rRNA)基因序列,以及联合序列(28S+18S)对分离自中国的11株巴贝斯虫进行系统进化分析.结果从11株巴贝斯虫基因组中都能顺利的扩增到目的序列,扩增到的基因大小为2,878bp-3,017bp,通过与18S rRNA的序列比较,28S rRNA比18S rRNA含有较多的序列信息.应用最大简约法(MP)和贝叶斯法(BI)分别针对18S rRNA、28S rRNA和28S+18S构建系统发育树,通过比较这三棵树,发现他们的拓扑结构也比较相似,只存在细微差异.28S+18S树的自展值和后验概率均要高于其它两棵树.28S能够较好的阐明莫氏巴贝斯虫,大巴贝斯虫和牛巴贝斯虫的遗传关系.总之,与之前基于18S rRNA和其它基因的研究结果比较,28S rRNA在巴贝斯虫上的进化分析可以帮助更好的解释巴贝斯虫种之间的进化关系.甚至在整个梨形虫的研究上,都可以考虑将28S rRNA作为一个新的候选标记基因.另外,将18S rRNA和28S rRNA两个基因连接到一起进行系统发育分析,并得到理想的结果,这也不失为在巴贝斯虫进化分析中的新尝试.

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来源
《中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第七次代表大会暨第十二次学术研讨会》|2013年|176-177|共2页
会议地点郑州
作者
苟惠天; 关贵全; 刘爱红; 刘志杰; 李有全; 任巧云; 陈泽; 杨吉飞; 殷宏; 罗建勋;
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作者单位

中国畜牧兽医学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 S852.723;
关键词
兽医学; 巴贝斯虫; 系统进化; 标记基因;

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