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小反刍兽疫P基因的克隆及其蛋白结构和B细胞表位的预测

摘要

本试验以小反刍兽疫病毒Nigeria75/1株为研究对象,通过RT-PCR法扩增P基因,利用DNAStar软件包中的Editseq将Nigeria75/1株苷酸序列翻译成氨基酸序列,然后利用Protean软件对其氨基酸序列进行分析,预测P蛋白的二级结构及B细胞抗原表位.结果表明,在Nigeria75/1株P蛋白的509个氨基酸序列中,多个区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,尤其是在N基端,可能是潜在的B细胞优势抗原表位,为分析P蛋白的生物学功能奠定了基础.

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