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基于SNP芯片进行苏尼特羊选择信号检测

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目的:通过苏尼特羊全基因组选择信号检测,寻找与选择相关的基因,揭示重要经济性状的遗传机制以及正向选择(Positive selection)在苏尼特羊品种培育过程中的作用机理.方法:文章基于illumina Ovine 50K芯片,采用r2度量苏尼特羊全基因组连锁不平衡程度(Linkage disequilibrium,LD),并利用单倍型积分值(Integrated haplotype score,iHS)选择信号检测方法对苏尼特羊进行全基因组选择信号检测.结果:共筛选到244个选择信号区段,并对这些区段进行基因注释找到979个候选基因,其中包括KDR、RUNX2、SOX6等与繁殖性状和骨骼发育相关的基因.最后通过生物信息学分析发现这些基因聚类在生物学过程、分子功能和细胞组分三个方面.结论:构建了苏尼特羊的LD图谱和正向选择信号图谱.

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来源
《中国畜牧兽医学会信息技术分会2013年学术研讨会》|2013年|135-146|共12页
会议地点山西太谷
作者
WANG Guang-kai; 王光凯; 曾滔; ZENG Tao; WANG Hui-hua; 王慧华; ZHANG Shu-zhen; 张淑珍; ZHANG Li; 张莉; WEI Cai-hong; 魏彩虹; 赵福平; ZHAO Fu-ping; DU Li-xin; 杜立新;
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作者单位

中国畜牧兽医学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类羊;
关键词
苏尼特羊; 基因芯片; 信号检测; 遗传育种;

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