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四种雁形目鸟类线粒体基因组全序列研究

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参照已有雁形目近缘物种的线粒体基因组序列,设计引物采用PCR扩增及测序技术获得了四种雁形目鸟类(中华秋沙鸭Mergus squamatus,豆雁Anserfabalis,鸳鸯Aix galericula和赤麻鸭Tadorna ferruginea)线粒体全基因组序列,分析了其基因组特点并对各基因进行了定位.结果表明:四种鸟类的线粒体基因组全长分别是16595 bp、16688 bp、16651 bp和16653 bp.其线粒体基因组全序列包括13个蛋白质编码基因(ND1-6、ND4L、ATP6、ATP8、COI-Ⅲ和Cytb)、2个rRNA基因(16S rRNA和12S rRNA)、22个tRNA基因和1个非编码的控制区(D-Loop区).四种雁形目鸟类的线粒体基因组各基因长度、位置与已知雁形目鸟类相似,其编码蛋白质区域和rRNA基因与其它雁形目鸟类具有很高的同源性,显示其线粒体基因组在进化上十分保守.蛋白质编码基因中,主要以ATN和GTG为起始密码子,终止密码子以典型的TAA,T-或TAG为主.非编码区包括少量的基因间隔区和控制区,控制区均位于tRNAGlu和tRNAPhe之间.预测了22个tRNA基因的二级结构,除tRNASer(AGN)和tRNAPhe缺少DHU臂外,其余均能折叠成典型的三叶草结构.2个rRNA基因(16S rRNA和12S rRNA)位于tRNAPhe和tRNALeu之间,并以tRNAVal间隔.

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来源
《第十二届全国鸟类学术研讨会暨第十届海峡两岸鸟类学术研讨会》|2013年|66|共1页
会议地点杭州
作者
刘刚; 周立志; 李博;
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作者单位

中国动物学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 Q959.723.03;
关键词
雁形目鸟类; 遗传学; 线粒体基因组; 序列分析;

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