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全基因组测序在一个Alstrom综合征家系发现ALMS1基因两个新的复合杂合突变

摘要

目的:Alstrom综合征是一种罕见的常染色体隐性遗传疾病.临床以儿童期视网膜病变导致的失明、感觉神经性耳聋、肥胖、Ⅱ型糖尿病、心肌病和肺、肝、肾脏衰竭为特征性表现.同时,Alstrom综合征具有高度的异质性,ALMS1是目前已知的致病基因.本研究对一个具有两例患者的中国家系的全基因组测序,旨在寻找该家系的遗传学致病原因,并分析其异质性的可能原因.方法:对两个患儿进行全面的临床信息分析收集,并采用二代测序技术(HiSeq2500,lllumina)进行家系四个成员(两名患儿)全基因测序.根据无相关遗传病家族史、两例男性患儿、相同疾病,故而采用常染色体隐性遗传、X连锁遗传疾病模式进行数据分析比对.结果:先证者男,17岁,其弟弟,7岁,两个患儿均表现为畏光、眼震颤、视锥视杆细胞发育不良,先证者还表现感音性耳聋、Ⅱ型糖尿病、血脂增高。全基因组测序结果,初步分析每个样本的数据量107.2-115.36 Gb,平均测序深度35.73-38.45,全基因组的覆盖度为99.83-99.85%。通过分析比对,发现ALMS,基因第8外显子两个未报道过的复合杂合突变,其中p.S1299SX来自父亲,p.R2144RX来自母亲,且这两个突变均导致了蛋白质的截短。同时,先证者还在BBS1基因检测到的来自母亲的p.R460H杂合错义突变,可能为造成先证者较其弟弟表型严重的原因。结论:本研究报道了罕见Alstrom综合征一个家系,发现了两个未报道过的复合杂合致病突变。高通量测序对于此类遗传异质性疾病提供了高效的检测方法,使得对于致病原因的探索及异质性的分析成为可能。

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