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四川番茄粉虱传双生病毒的PCR检测及序列分析

摘要

从四川攀枝花市采集表现植株矮化,叶片黄化及曲叶症状的样品SC64、SC65、SC66和SC67用双生病毒通用引物PA和PB进行PCR检测,从4个样品中均扩增出约500bp的特异条带。随后根据此片段测序结果设计引物Y65-F/Y65-R扩增SC65的DNA-A近全长,经克隆及测序拼接后得到SC65的全基因组序列,其大小为2732 nts,将SC65全长基因组DNA与GenBank中的序列进行比对发现,SC65与一个分离自云南元谋的TYLCCNV的菜豆分离物(TYLCCNV-Bean-YM)相似性最高,为96.0%,表明SC65是TYLCCNV的一个分离物。利用TYLCCNV的特异性引物YSF1/Y6R2对病毒分离物SC64、SC66和SC67进行PCR扩增,结果从这3个样本中均扩增到TYLCCNV约1.3kb的特异性条带,表明这些番茄样品均受到TYLCCNV的侵染。利用双生病毒卫星DNA通用引物beta0l/beta02进行PCR扩增,4个样品均得到预期大小为1.3kb的特异性条带。全序列测定表明SC65 DNA的全基因组序列为1338nts。未能从样品中检测到DNA1分子的存在。

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