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鸡缨头性状相关候选基因的表达及关联分析研究

摘要

本研究发现并验证了一个影响鸡缨头性状的Hox基因,其仅在特异头部皮肤组织中呈现出与表型对应的表达水平差异,而在其他组织中均无差异现象产生。利用BAC测序的方法,对公布的鸡基因组内该Hox基因亚簇的序列进行了完善和补充,确定了差异基因的结构,并寻找到差异基因附近的有效的多态性SNP及微卫星标记,利用全基因组关联分析的方法,发现对于Crest性状目的基因上下游标记显著值均为最高,证明了该Hox基因与缨头性状的相关性。此外,Hox基因家族作为一类参与动物胚胎发育调控的重要转录因子家族,其表达模式大多符合共线性法则,即位于基因组3’端的基因,表达区域更靠近头部,而表达时间也更早。但已有报道表明一些基因会呈现出非共线性的表达模式。本研究在丝羽乌骨鸡头部皮肤中检测到非3’端基因的表达,这与早期的鸡皮肤中其他Hox基因的表达模式研究及小鼠等其他物种中的个例相符,同时也为共线性法则的适用局限性提供了新的论据。

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