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猪microRNA分离鉴定及调控肌肉生长发育的功能研究

摘要

通过构建猪骨骼肌及混合组织小分子RNA的cDNA文库,通过Solexa测序及生物信息学注释,共鉴定了460个猪保守和67个新miRNA,其中保守miRNA包含数据库收录的65个猪miRNA.比较发现鉴定的miRNA分别有269、194和164个与人、小鼠和大鼠相应miRNA序列完全一致.采用miRDeep程序对Solexa测序数据分析还发现了19个“miRNA样”新型小分子RNA,这些小分子RNA大小为27-30nt,其二级结构与miRNA前体特征完全一致.由同源比对法分析测序数据还发现了66个猪保守piwiRNAs(piRNAs)。以C2C12细胞系为miRNAs功能研究的体外模型,拟通过差异表达分析、过表达或抑制表达研究及靶基因预测和验证等方法鉴定了部分miRNAs在成肌细胞分化不同时期的表达情况,确定了miRNAs在肌细胞增殖或分化中的作用,鉴定miRNAs的新的靶基因,综合分析了部分miRNAs在肌发生中的作用及作用的分子机制。

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