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一种新的DNA分子标记技术(Start Codon-Simple Sequence Repeat)SC-SSR

摘要

综合SCoT和ISSR分子标记技术开发了一种既能将标记位点与表达序列紧密联系,又具有相对较高的多态性的新的分子标记技术--SC-SSR。SC-SSR标记是基于PCR的标记系统,上游引物用SCoT标记引物,下游引物用ISSR标记引物,上下游引物间可自由组配,引物设计原则同SCoT标记和ISSR标记,使用50℃的退火温度,保证了扩增结果的稳定性。PCR结果采用琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酞胺凝胶电泳检测。SC-SSR分子标记结合了ISSR标记和SCOT标记的优点,具有操作简单、成本低廉、多态性丰富、重复性好、引物设计简单且通用性良好、与表达序列紧密连锁等诸多优点。可用于种质资源的鉴定评价、遗传图谱的构建、重要性状基因标记、gDNA与cDNA指纹分析乃至图位克隆等方面。

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