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Heterogeneous Data Fusion to Type Brain Tumor Biopsies

机译:异构数据融合以类型脑肿瘤活检。

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摘要

Current research in biomedical informatics involves analysis of multiple heterogeneous data sets. This includes patient demographics, clinical and pathology data, treatment history, patient outcomes as well as gene expression, DNA sequences and other information sources such as gene ontology. Analysis of these data sets could lead to better disease diagnosis, prognosis, treatment and drug discovery. In this paper, we use machine learning algorithms to create a novel framework to perform the heterogeneous data fusion on both metabolic and molecular datasets, including state-of-the-art high-resolution magic angle spinning (HRMAS) proton (1H) Magnetic Resonance Spectroscopy and gene transcriptome profiling, to intact brain tumor biopsies and to identify different profiles of brain tumors. Our experimental results show our novel framework outperforms any analysis using individual dataset.
机译:生物医学信息学的当前研究涉及多个异类数据集的分析。这包括患者人口统计学,临床和病理数据,治疗史,患者预后以及基因表达,DNA序列和其他信息来源,例如基因本体论。这些数据集的分析可以导致更好的疾病诊断,预后,治疗和药物发现。在本文中,我们使用机器学习算法创建了一个新颖的框架,以对代谢数据集和分子数据集执行异类数据融合,包括最新的高分辨率魔角旋转(HRMAS)质子(1H)磁共振光谱学和基因转录组分析,以完整的脑肿瘤活组织检查并鉴定脑肿瘤的不同特征。我们的实验结果表明,我们的新颖框架优于使用单个数据集进行的任何分析。

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