• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文会议>Engineering in Medicine and Biology Society, 2004. IEMBS '04. 26th Annual International Conference of the IEEE >Cellular function prediction and biological pathway discovery in Arabidopsis thaliana using microarray data
【24h】

Cellular function prediction and biological pathway discovery in Arabidopsis thaliana using microarray data

机译：利用芯片数据预测拟南芥中细胞功能的预测和生物学途径的发现

获取原文
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

We have developed a new integrated probabilistic method for cellular function prediction by using microarray gene expression profiles, in conjunction with predicted protein-protein interactions and annotations of known proteins through an integrative statistical model. Our approach is based on a novel assessment for the relationship between correlation of two genes' expression profiles and their functional relationship in terms of the gene ontology (GO) hierarchy. We applied the method for function predictions of hypothetical genes in Arabidopsis. We have also extended our computational method using Dijkstra's algorithm to identify the components and topology of a pathway, and we applied it for predicting the signaling pathway of phosphatidic acid as a second messenger in Arabidopsis.
机译：我们已经通过使用微阵列基因表达谱，结合预测的蛋白质-蛋白质相互作用和通过综合统计模型对已知蛋白质的注释，开发了一种用于细胞功能预测的新的综合概率方法。我们的方法基于一种新颖的评估方法，即根据基因本体论（GO）层次结构，对两个基因表达谱的相关性与其功能关系之间的关系进行了评估。我们将该方法用于拟南芥中假设基因的功能预测。我们还扩展了使用Dijkstra算法的计算方法，以识别途径的组成部分和拓扑，并将其用于预测作为拟南芥中第二信使的磷脂酸的信号传导途径。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号